32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1688 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1688  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  833    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00694516  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  57.88 
 
 		 642 aa  469  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  29.1 
 
 		 663 aa  97.4  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  24.25 
 
 		 699 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2312  hypothetical protein  27.41 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3199  hypothetical protein  24.38 
 
 		 693 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2920  hypothetical protein  24.38 
 
 		 693 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  22.12 
 
 		 666 aa  56.6  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  22.28 
 
 		 676 aa  56.2  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  24.87 
 
 		 790 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0740  hypothetical protein  22.18 
 
 		 660 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.305327 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2085  DNA repair ATPase-like protein  27.35 
 
 		 686 aa  51.2  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0395547  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  26.34 
 
 		 657 aa  50.4  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0037  RecF/RecN/SMC domain-containing protein  29.09 
 
 		 638 aa  50.1  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000359393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  20.6 
 
 		 690 aa  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  24.65 
 
 		 794 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2151  hypothetical protein  19.77 
 
 		 690 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  33 
 
 		 1061 aa  48.9  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.5 
 
 		 370 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  34.43 
 
 		 514 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00117  DNA repair ATPase  22.51 
 
 		 704 aa  47.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.621069  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  28.3 
 
 		 924 aa  46.6  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  29.59 
 
 		 978 aa  45.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4583  RecF/RecN/SMC N domain, putative  35.85 
 
 		 875 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  24.19 
 
 		 683 aa  44.3  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  31.78 
 
 		 789 aa  44.3  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4596  hypothetical protein  23.66 
 
 		 879 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0852353  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  31.51 
 
 		 895 aa  43.9  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  34.29 
 
 		 891 aa  43.5  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  28.81 
 
 		 368 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  27.27 
 
 		 864 aa  43.1  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  30.91 
 
 		 1099 aa  43.1  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>