56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0037 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0037  RecF/RecN/SMC domain-containing protein  100 
 
 		 638 aa  1302    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000359393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45350  predicted protein  23.95 
 
 		 1335 aa  83.6  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  19.47 
 
 		 1007 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  23.79 
 
 		 1023 aa  70.5  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  24.42 
 
 		 1031 aa  68.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  22.57 
 
 		 1007 aa  67.4  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  28.65 
 
 		 1019 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  20.85 
 
 		 1008 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  20.85 
 
 		 1008 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 1022 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  20.82 
 
 		 1016 aa  65.1  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  25.85 
 
 		 859 aa  64.3  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  26.25 
 
 		 1008 aa  63.9  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  25.16 
 
 		 859 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  25.16 
 
 		 859 aa  62.4  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  25.29 
 
 		 902 aa  61.6  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  25.66 
 
 		 1022 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  19.73 
 
 		 1019 aa  60.8  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  24.38 
 
 		 1003 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  26.32 
 
 		 910 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_25194  predicted protein  25.11 
 
 		 1266 aa  58.5  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.551119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  26.4 
 
 		 789 aa  58.2  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  24.55 
 
 		 895 aa  58.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  26.92 
 
 		 852 aa  57.4  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  26.92 
 
 		 852 aa  57  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  29.94 
 
 		 514 aa  55.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2553  SMC domain protein  26.94 
 
 		 829 aa  55.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  26.22 
 
 		 924 aa  54.7  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  25.54 
 
 		 1057 aa  54.3  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  25.89 
 
 		 812 aa  53.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  32.05 
 
 		 1046 aa  52.4  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  23.53 
 
 		 857 aa  51.6  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  27.45 
 
 		 804 aa  50.8  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1688  hypothetical protein  29.09 
 
 		 427 aa  50.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00694516  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  24.18 
 
 		 955 aa  49.3  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  32.43 
 
 		 891 aa  48.1  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2085  DNA repair ATPase-like protein  32.5 
 
 		 686 aa  48.1  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0395547  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  18.98 
 
 		 993 aa  47.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  23.79 
 
 		 935 aa  47  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  18.83 
 
 		 993 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  24.15 
 
 		 961 aa  46.6  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1637  putative DNA repair ATPase  27.04 
 
 		 774 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5278  hypothetical protein  27.04 
 
 		 774 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0366308  normal  0.984041 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  31.17 
 
 		 890 aa  46.6  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1391  SMC domain protein  32.73 
 
 		 526 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  27.5 
 
 		 1029 aa  46.2  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1215  heme ABC export system, ATP-binding protein CcmA  37.97 
 
 		 220 aa  45.8  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  20.85 
 
 		 693 aa  45.4  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  29.06 
 
 		 1307 aa  45.1  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  27.92 
 
 		 1025 aa  44.3  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  39.39 
 
 		 1174 aa  44.3  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0446  hypothetical protein  32.47 
 
 		 571 aa  44.3  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  33.33 
 
 		 233 aa  44.3  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  36.49 
 
 		 1199 aa  43.9  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  29.21 
 
 		 1009 aa  43.9  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  28.21 
 
 		 1303 aa  43.9  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>