95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3445 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  100 
 
 
628 aa  1288    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.25 
 
 
608 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.1 
 
 
634 aa  360  4e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.45 
 
 
616 aa  296  1e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  41.59 
 
 
513 aa  278  2e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  38.57 
 
 
505 aa  248  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.11 
 
 
613 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  38.07 
 
 
276 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.18 
 
 
603 aa  87.8  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.04 
 
 
607 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2740  hypothetical protein  51.69 
 
 
150 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  21.48 
 
 
529 aa  78.6  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  23.24 
 
 
653 aa  73.2  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.74 
 
 
652 aa  72.8  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  29.17 
 
 
666 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  20.57 
 
 
574 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.22 
 
 
605 aa  65.1  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  21.97 
 
 
604 aa  63.5  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  25.5 
 
 
581 aa  62  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  21.29 
 
 
663 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  27.92 
 
 
626 aa  58.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  22.3 
 
 
681 aa  58.2  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  25 
 
 
626 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  27.27 
 
 
634 aa  57.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  23.49 
 
 
645 aa  56.6  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  25.54 
 
 
607 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  26.17 
 
 
610 aa  55.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.7 
 
 
550 aa  55.1  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1872  hypothetical protein  25.75 
 
 
585 aa  55.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.11 
 
 
708 aa  55.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.73 
 
 
594 aa  54.7  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.05 
 
 
640 aa  54.3  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1535  RloH  28.42 
 
 
588 aa  53.5  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000290266  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  23.43 
 
 
591 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  23.81 
 
 
564 aa  51.6  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  31.53 
 
 
619 aa  51.6  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1796  hypothetical protein  23.94 
 
 
676 aa  51.6  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  23.35 
 
 
457 aa  51.2  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0681  hypothetical protein  24.65 
 
 
619 aa  51.2  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0196  hypothetical protein  23.33 
 
 
654 aa  50.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  33.59 
 
 
595 aa  50.8  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  25.69 
 
 
598 aa  50.8  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.75 
 
 
608 aa  50.8  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  38.46 
 
 
159 aa  50.8  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.35 
 
 
639 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.35 
 
 
647 aa  49.7  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  23.03 
 
 
645 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  24.14 
 
 
566 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  21.76 
 
 
688 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  25.15 
 
 
669 aa  48.9  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  35.82 
 
 
623 aa  48.5  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.57 
 
 
615 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  32.18 
 
 
586 aa  48.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.15 
 
 
589 aa  48.1  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4055  hypothetical protein  44 
 
 
494 aa  47.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.945685  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.48 
 
 
642 aa  47.8  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  34.25 
 
 
579 aa  47.4  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  31.03 
 
 
641 aa  47.4  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.71 
 
 
548 aa  47.4  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3650  hypothetical protein  48 
 
 
426 aa  47.4  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574815  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  31.43 
 
 
648 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  23.5 
 
 
642 aa  47  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  27.82 
 
 
416 aa  47  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  25.25 
 
 
580 aa  47  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  25.7 
 
 
685 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  31.52 
 
 
598 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02258  hypothetical protein  51.11 
 
 
626 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  25.59 
 
 
586 aa  46.2  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  32.65 
 
 
495 aa  45.8  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  29.07 
 
 
603 aa  46.2  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  23.36 
 
 
429 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  33.33 
 
 
598 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  23.08 
 
 
595 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  23.83 
 
 
680 aa  45.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  29.61 
 
 
643 aa  45.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  21.91 
 
 
396 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.69 
 
 
677 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.69 
 
 
677 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0029  ABC transporter ATP-binding protein  30.69 
 
 
431 aa  44.7  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  26.53 
 
 
497 aa  44.7  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0837  hypothetical protein  51.06 
 
 
644 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.387147  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  23.62 
 
 
641 aa  44.7  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4715  hypothetical protein  55.81 
 
 
255 aa  44.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214433  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0571  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.04 
 
 
614 aa  44.3  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  48.98 
 
 
690 aa  44.3  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  27.78 
 
 
452 aa  44.3  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  45.45 
 
 
583 aa  44.3  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  30.83 
 
 
1175 aa  43.9  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  40 
 
 
573 aa  43.9  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  24.85 
 
 
674 aa  43.5  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  26.04 
 
 
514 aa  43.9  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  25 
 
 
593 aa  43.9  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  22.39 
 
 
597 aa  43.9  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25506  predicted protein  37.25 
 
 
1237 aa  43.9  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  26.06 
 
 
667 aa  43.9  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>