27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4566 on replicon NC_009998
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009998  Sbal195_4566  ATPase involved in DNA repair  100 
 
 		 1059 aa  2134    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0040  DNA repair ATPase  31.27 
 
 		 1051 aa  382  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000057692  hitchhiker  0.00102482 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2709  SMC domain protein  46.54 
 
 		 1036 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0065  SMC domain protein  36.71 
 
 		 985 aa  107  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4596  hypothetical protein  28.48 
 
 		 879 aa  73.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0852353  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  28.46 
 
 		 682 aa  65.5  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4388  SMC domain-containing protein  32.56 
 
 		 1041 aa  62.8  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.33249 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4583  RecF/RecN/SMC N domain, putative  27.07 
 
 		 875 aa  62  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2588  SMC domain protein  25 
 
 		 687 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326587  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  33.08 
 
 		 1174 aa  50.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  27.27 
 
 		 1204 aa  49.3  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  26.32 
 
 		 808 aa  48.9  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  28.75 
 
 		 1168 aa  48.9  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  32.93 
 
 		 890 aa  48.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  28.36 
 
 		 1184 aa  47.4  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2668  hypothetical protein  26.38 
 
 		 695 aa  47.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  35.44 
 
 		 803 aa  47  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5100  SMC domain protein  33.68 
 
 		 676 aa  47.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.797675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  29.57 
 
 		 833 aa  46.2  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1177 aa  45.8  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  37.14 
 
 		 1176 aa  45.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  34.78 
 
 		 796 aa  45.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  37.14 
 
 		 1176 aa  45.4  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  37.68 
 
 		 1176 aa  45.4  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  37.68 
 
 		 1175 aa  45.4  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  24.82 
 
 		 1179 aa  45.1  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  23.14 
 
 		 852 aa  44.7  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>