103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2668 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2668  hypothetical protein  100 
 
 		 695 aa  1375    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5100  SMC domain protein  67.42 
 
 		 676 aa  840    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.797675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  37.3 
 
 		 796 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  36.83 
 
 		 890 aa  334  3e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  34 
 
 		 872 aa  53.9  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  29.7 
 
 		 789 aa  50.4  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7587  SMC domain-containing protein  26.07 
 
 		 873 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328529  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2588  SMC domain protein  50 
 
 		 687 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326587  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  37.14 
 
 		 1198 aa  49.7  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  31.4 
 
 		 1179 aa  48.9  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2640  chromosome segregation protein SMC  45.65 
 
 		 1192 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2998  DNA replication and repair protein RecF  38.3 
 
 		 357 aa  48.9  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0957887  normal  0.356139 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  42 
 
 		 1215 aa  48.5  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0040  DNA repair ATPase  29.41 
 
 		 1051 aa  48.5  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000057692  hitchhiker  0.00102482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  36.78 
 
 		 868 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  46 
 
 		 1200 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  45.65 
 
 		 1189 aa  48.5  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  32.46 
 
 		 1179 aa  48.5  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  46.67 
 
 		 1201 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0008  recombination protein F  30.28 
 
 		 360 aa  48.1  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0621721  hitchhiker  0.00000000274736 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  43.48 
 
 		 1190 aa  48.1  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0005  recombination protein F  38.55 
 
 		 387 aa  48.1  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  37.5 
 
 		 1196 aa  48.1  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  34.25 
 
 		 1179 aa  47.8  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  41.33 
 
 		 881 aa  47.8  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  39.68 
 
 		 1225 aa  47.8  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  39.22 
 
 		 1208 aa  47.8  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4566  ATPase involved in DNA repair  25 
 
 		 1059 aa  47.8  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  41.33 
 
 		 808 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  31.33 
 
 		 1187 aa  47.4  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6595  hypothetical protein  30.69 
 
 		 880 aa  47  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  44.9 
 
 		 346 aa  47  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  37.33 
 
 		 874 aa  47  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  44 
 
 		 891 aa  47  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1761  cell division ATP-binding protein FtsE  33.01 
 
 		 231 aa  46.6  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  32.56 
 
 		 1187 aa  47  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3692  hypothetical protein  27.17 
 
 		 891 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000374969 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  30.12 
 
 		 1189 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  30.12 
 
 		 1189 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  30.12 
 
 		 1189 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1830  hypothetical protein  26.07 
 
 		 955 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  30.12 
 
 		 1189 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  31.58 
 
 		 895 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  36.36 
 
 		 784 aa  46.6  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  36.07 
 
 		 993 aa  46.6  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0003  recombination protein F  42.59 
 
 		 360 aa  46.2  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0003  recombination protein F  42.59 
 
 		 360 aa  46.6  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  36.07 
 
 		 993 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  45.65 
 
 		 1185 aa  46.6  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  43.75 
 
 		 1172 aa  45.8  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  30.12 
 
 		 1189 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5480  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1304 aa  46.6  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  35.44 
 
 		 1194 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1551  SMC domain-containing protein  50 
 
 		 1074 aa  46.2  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625316 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  30.12 
 
 		 1189 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0003  recombination protein F  40.74 
 
 		 360 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133569  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0003  recombination protein F  40.74 
 
 		 360 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0977543  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0003  recombination protein F  40.74 
 
 		 360 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  30.12 
 
 		 1189 aa  45.8  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  46.81 
 
 		 682 aa  45.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0003  recombination protein F  40.74 
 
 		 360 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0851424  hitchhiker  0.00000000117147 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  30.12 
 
 		 1189 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  30.12 
 
 		 1189 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  30.12 
 
 		 1189 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  32.56 
 
 		 1190 aa  45.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  43.48 
 
 		 1234 aa  45.4  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_004310  BR0003  recombination protein F  39.68 
 
 		 384 aa  45.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0003  recombination protein F  42.59 
 
 		 360 aa  45.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0384357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  41.3 
 
 		 1190 aa  45.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  45.45 
 
 		 1186 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0003  recombination protein F  39.68 
 
 		 384 aa  45.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0080717  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  36.07 
 
 		 993 aa  45.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  42.55 
 
 		 1224 aa  45.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  38.71 
 
 		 1184 aa  45.4  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  42.11 
 
 		 376 aa  44.7  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0015  recombination protein F  42.59 
 
 		 360 aa  44.7  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00214178  hitchhiker  0.000779425 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_641  chromosome condensation and segregation protein  35.29 
 
 		 1011 aa  45.1  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  30.12 
 
 		 1189 aa  44.7  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  27.42 
 
 		 1148 aa  45.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  31.51 
 
 		 1184 aa  44.7  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  43.48 
 
 		 1181 aa  45.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  43.48 
 
 		 1183 aa  44.7  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  36.11 
 
 		 833 aa  44.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2051  SMC domain protein  52.38 
 
 		 1080 aa  44.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.380302  normal  0.930097 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  37.14 
 
 		 1185 aa  44.7  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  35.94 
 
 		 1174 aa  44.3  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  35.94 
 
 		 1177 aa  44.3  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0003  recombination protein F  35.14 
 
 		 368 aa  44.3  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000843052  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  32.94 
 
 		 852 aa  44.3  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  29.07 
 
 		 1178 aa  44.3  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  37.5 
 
 		 1190 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  35.53 
 
 		 1194 aa  44.3  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0183  ABC transporter related  26.55 
 
 		 226 aa  43.9  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.337585  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0188  ABC transporter related  26.55 
 
 		 226 aa  43.9  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0003  recombination protein F  33.73 
 
 		 364 aa  43.9  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0185053  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  27.37 
 
 		 869 aa  43.9  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  34.92 
 
 		 1146 aa  43.9  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  43.48 
 
 		 1227 aa  43.9  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  41.3 
 
 		 1191 aa  43.9  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0003  recombination protein F  37.04 
 
 		 361 aa  43.9  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>