More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1551 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1551  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 1074 aa  2078    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625316 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2051  SMC domain protein  55.06 
 
 		 1080 aa  965    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.380302  normal  0.930097 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  28.69 
 
 		 1187 aa  360  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  26.51 
 
 		 1190 aa  337  7.999999999999999e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  28.04 
 
 		 1189 aa  335  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.31 
 
 		 1185 aa  333  9e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  26.39 
 
 		 1190 aa  330  7e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  29.58 
 
 		 1198 aa  329  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  27.71 
 
 		 1189 aa  329  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  26.54 
 
 		 1189 aa  324  7e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  30.19 
 
 		 1199 aa  320  7e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  27.55 
 
 		 1189 aa  320  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  27.55 
 
 		 1189 aa  320  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  27.41 
 
 		 1189 aa  318  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  27.17 
 
 		 1189 aa  318  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  27.38 
 
 		 1189 aa  317  8e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  27.38 
 
 		 1189 aa  317  8e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  29.4 
 
 		 1186 aa  316  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  27.38 
 
 		 1185 aa  315  3.9999999999999997e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  27.55 
 
 		 1181 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  26.4 
 
 		 1196 aa  305  4.0000000000000003e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.77 
 
 		 1170 aa  302  2e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  26.95 
 
 		 1174 aa  302  2e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  25.27 
 
 		 1164 aa  301  4e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  25.33 
 
 		 1191 aa  296  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  26.71 
 
 		 1170 aa  294  7e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  27.55 
 
 		 1187 aa  286  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  27.46 
 
 		 1176 aa  270  8e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  24.54 
 
 		 1177 aa  269  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf735  chromosome segregation ATPase Smc  26.16 
 
 		 978 aa  255  3e-66  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  24.06 
 
 		 1153 aa  251  4e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  26.07 
 
 		 1186 aa  244  6e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  28.55 
 
 		 1185 aa  244  9e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  21.5 
 
 		 1180 aa  239  1e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  30.48 
 
 		 1191 aa  236  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  28.01 
 
 		 1134 aa  234  6e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  26.97 
 
 		 1188 aa  232  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  26.97 
 
 		 1188 aa  232  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  22.62 
 
 		 1174 aa  232  4e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  29.86 
 
 		 1189 aa  231  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  24.79 
 
 		 1185 aa  229  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  28.69 
 
 		 1189 aa  228  6e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  26.53 
 
 		 1171 aa  225  3e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  29.13 
 
 		 1189 aa  225  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  28.58 
 
 		 1171 aa  224  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  26.88 
 
 		 1179 aa  224  9e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  27.6 
 
 		 1167 aa  223  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  22.39 
 
 		 1172 aa  219  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  26.81 
 
 		 1184 aa  215  2.9999999999999995e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  28.03 
 
 		 1179 aa  214  5.999999999999999e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0156  p115 protein  23.24 
 
 		 981 aa  213  1e-53  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  29.62 
 
 		 1198 aa  212  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  24.67 
 
 		 1175 aa  208  5e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  25.72 
 
 		 1217 aa  204  8e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  29.8 
 
 		 1199 aa  203  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  29.8 
 
 		 1199 aa  203  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  28.19 
 
 		 1177 aa  199  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  26.74 
 
 		 1308 aa  196  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  23.74 
 
 		 1174 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  30.56 
 
 		 1185 aa  191  5.999999999999999e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  24.63 
 
 		 1185 aa  191  8e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  25.31 
 
 		 1226 aa  191  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  21.64 
 
 		 1189 aa  189  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  24.89 
 
 		 1185 aa  189  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  24.85 
 
 		 1172 aa  187  9e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  29.14 
 
 		 1176 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  22.37 
 
 		 1189 aa  184  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  21.43 
 
 		 1189 aa  184  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  27.1 
 
 		 1186 aa  182  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  24.51 
 
 		 1192 aa  181  5.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0822  SMC protein-like protein  44.76 
 
 		 1100 aa  180  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.866363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  25.91 
 
 		 1147 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  25.46 
 
 		 1188 aa  170  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  29.47 
 
 		 1191 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0495  structural maintenance of chromosomes (SMC) superfamily protein  24.57 
 
 		 988 aa  166  3e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.210313  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.12 
 
 		 1201 aa  165  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  28.4 
 
 		 1208 aa  164  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  28.06 
 
 		 1175 aa  163  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  28.32 
 
 		 1175 aa  162  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  28.53 
 
 		 1226 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  38.04 
 
 		 1195 aa  158  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  38.04 
 
 		 1195 aa  158  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  38.04 
 
 		 1195 aa  158  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  26.73 
 
 		 1146 aa  157  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  24.02 
 
 		 1183 aa  157  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  35.98 
 
 		 1194 aa  157  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  39.46 
 
 		 1199 aa  156  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  38.55 
 
 		 1217 aa  155  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  41.71 
 
 		 1176 aa  154  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  29.77 
 
 		 1224 aa  154  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  30.06 
 
 		 1173 aa  154  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  36.82 
 
 		 1194 aa  153  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  36.05 
 
 		 1176 aa  152  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  24.44 
 
 		 1148 aa  152  3e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  25.95 
 
 		 1149 aa  151  7e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  32.38 
 
 		 1164 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  26.65 
 
 		 1194 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  39.09 
 
 		 1234 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  39.07 
 
 		 1195 aa  149  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  39.07 
 
 		 1222 aa  149  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>