83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0470 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 346 aa  699    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  52.45 
 
 		 349 aa  363  3e-99  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1481  hypothetical protein  55.4 
 
 		 140 aa  160  4e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  21.43 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  23.69 
 
 		 495 aa  63.5  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1861  hypothetical protein  24.12 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0937  ATPase-like protein  21.21 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1457  putative ATPase  24.48 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  23.68 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1472  ATPase-like protein  26.61 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0862565  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2549  SMC domain protein  23.5 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0441079  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  24 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  23.92 
 
 		 439 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  21.56 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  25.14 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4266  ATPase-like protein  21.47 
 
 		 361 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  20.92 
 
 		 356 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  42.86 
 
 		 323 aa  49.7  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2592  hypothetical protein  22.16 
 
 		 429 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  28.28 
 
 		 597 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1141  ATPase-like protein  20.85 
 
 		 366 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956923  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1544  ATPase-like protein  38.46 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0152832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  22.69 
 
 		 355 aa  47.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  22.29 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  19.78 
 
 		 396 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  48.94 
 
 		 371 aa  47  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2668  hypothetical protein  44.9 
 
 		 695 aa  47  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0003  DNA replication and repair protein RecF  53.49 
 
 		 354 aa  47  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00180653  normal  0.423581 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  22.91 
 
 		 368 aa  46.6  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  22.48 
 
 		 408 aa  46.6  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0003  recombination protein F  50 
 
 		 360 aa  46.2  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0003  recombination protein F  47.5 
 
 		 360 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0851424  hitchhiker  0.00000000117147 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  47.06 
 
 		 543 aa  46.2  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0003  recombination protein F  47.5 
 
 		 360 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0977543  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0003  recombination protein F  47.5 
 
 		 360 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0003  recombination protein F  47.5 
 
 		 360 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133569  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  34.78 
 
 		 397 aa  46.2  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0003  DNA replication and repair protein  40 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0109066  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  35.8 
 
 		 554 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0003  recombination protein F  45 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.029356  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0003  recombination protein F  45 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.316978  hitchhiker  0.00705664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0011  recombination protein F  45 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00668622  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0003  DNA replication and repair protein RecF  40 
 
 		 357 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167718  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  41.07 
 
 		 804 aa  45.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.25 
 
 		 634 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  36.73 
 
 		 382 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  31.94 
 
 		 688 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  29.63 
 
 		 486 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  36.73 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.68 
 
 		 548 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  22.16 
 
 		 564 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1225  DNA replication and repair protein RecF  50 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.193168  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  27.38 
 
 		 572 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1132  hypothetical protein  25.43 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0249333  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  46 
 
 		 382 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  34.38 
 
 		 405 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0010  recombination protein F  45 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  34.25 
 
 		 457 aa  44.7  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  20.71 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  27.16 
 
 		 464 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  23.51 
 
 		 406 aa  44.3  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_641  chromosome condensation and segregation protein  26.28 
 
 		 1011 aa  44.3  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  41.27 
 
 		 935 aa  44.3  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  40 
 
 		 993 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0666  DNA replication and repair protein RecF  22.37 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0186794  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  21.05 
 
 		 378 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  29.81 
 
 		 428 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  42.55 
 
 		 1209 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3860  hypothetical protein  44.19 
 
 		 345 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.925149  normal  0.074002 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  40 
 
 		 993 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  47.83 
 
 		 371 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  47.62 
 
 		 362 aa  43.1  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  21.02 
 
 		 581 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  41.3 
 
 		 650 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3757  hypothetical protein  41.3 
 
 		 532 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  40 
 
 		 993 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0015  recombination protein F  45 
 
 		 360 aa  43.1  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00214178  hitchhiker  0.000779425 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  27.34 
 
 		 397 aa  43.1  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  26.95 
 
 		 398 aa  43.1  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2689  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  46.55 
 
 		 240 aa  42.7  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.56 
 
 		 607 aa  42.7  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  26.27 
 
 		 386 aa  42.4  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  42.22 
 
 		 353 aa  42.7  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>