120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1462 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  100 
 
 		 423 aa  861    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  92.18 
 
 		 422 aa  807    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  36.58 
 
 		 482 aa  288  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  37.02 
 
 		 452 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  37.71 
 
 		 455 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  37.9 
 
 		 430 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  35.01 
 
 		 449 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  31.85 
 
 		 437 aa  177  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  31.46 
 
 		 410 aa  176  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  32.97 
 
 		 406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  31.56 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  27.95 
 
 		 422 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  26.22 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  26.09 
 
 		 440 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  31.12 
 
 		 454 aa  137  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  28.83 
 
 		 442 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  44.87 
 
 		 203 aa  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  29.28 
 
 		 439 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  34.07 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  42.4 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  26.94 
 
 		 427 aa  109  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  29.28 
 
 		 478 aa  103  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  24.78 
 
 		 445 aa  97.1  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  37.14 
 
 		 464 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  44.79 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  54.67 
 
 		 577 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  25.29 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  41.38 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  28.62 
 
 		 709 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  31.76 
 
 		 769 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  25.19 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  36.72 
 
 		 736 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  60.78 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.16 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  25.51 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  24.47 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  34.55 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  35.37 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  36.84 
 
 		 608 aa  59.7  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  29.63 
 
 		 532 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  39.76 
 
 		 610 aa  56.6  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  23.2 
 
 		 596 aa  55.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  32.29 
 
 		 458 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  36.08 
 
 		 352 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  36.47 
 
 		 339 aa  51.6  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1135  hypothetical protein  24.12 
 
 		 447 aa  51.2  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.879789  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  26.24 
 
 		 712 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  36.51 
 
 		 619 aa  50.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  45.1 
 
 		 452 aa  50.1  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  33.67 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  34.78 
 
 		 353 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0007  AAA ATPase  24.02 
 
 		 380 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  38.98 
 
 		 582 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1018  hypothetical protein  29.03 
 
 		 606 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88989e-33 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  52.63 
 
 		 552 aa  47  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  34.62 
 
 		 1149 aa  47  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0005  recombination protein F  47.83 
 
 		 387 aa  47  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  31.4 
 
 		 369 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0883  hypothetical protein  41.94 
 
 		 79 aa  47.4  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0003  recombination protein F  47.83 
 
 		 384 aa  47  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  42.55 
 
 		 1074 aa  47  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  24.78 
 
 		 401 aa  47  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0003  recombination protein F  47.83 
 
 		 384 aa  47  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0080717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0015  DNA replication and repair protein RecF  34.12 
 
 		 340 aa  46.6  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  42.22 
 
 		 555 aa  46.6  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3230  hypothetical protein  35.71 
 
 		 113 aa  46.6  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0080421  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.43 
 
 		 380 aa  46.6  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  21.67 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  36.62 
 
 		 626 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  32.35 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.62 
 
 		 626 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.52 
 
 		 616 aa  45.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 574 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  21.31 
 
 		 588 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4596  hypothetical protein  24.24 
 
 		 879 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0852353  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  28.12 
 
 		 634 aa  45.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0003  DNA replication and repair protein RecF  42.11 
 
 		 362 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000176519  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  30.58 
 
 		 560 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  50 
 
 		 556 aa  45.1  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4117  SMC domain-containing protein  39.58 
 
 		 944 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  28.36 
 
 		 176 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3475  SMC domain protein  39.58 
 
 		 944 aa  45.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.508672  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  28 
 
 		 652 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  41.86 
 
 		 895 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  39.58 
 
 		 650 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.83 
 
 		 594 aa  44.3  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.71 
 
 		 362 aa  44.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1963  hypothetical protein  22.63 
 
 		 265 aa  44.3  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  30.68 
 
 		 875 aa  44.3  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  36.23 
 
 		 874 aa  44.3  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  24.29 
 
 		 427 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  27.88 
 
 		 371 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4769  SMC domain-containing protein  36.73 
 
 		 944 aa  43.9  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2377  hypothetical protein  30.69 
 
 		 581 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  38.18 
 
 		 452 aa  43.9  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  36.21 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  27.74 
 
 		 708 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  47.62 
 
 		 573 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  33.8 
 
 		 159 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  29.92 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>