21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5366 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3707  SMC domain-containing protein  49.55 
 
 		 881 aa  859    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3982  hypothetical protein  49.83 
 
 		 881 aa  817    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0815711  hitchhiker  0.00348599 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5366  hypothetical protein  100 
 
 		 892 aa  1816    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.0115994 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0450  SMC domain protein  38.13 
 
 		 877 aa  541  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1420  hypothetical protein  38.2 
 
 		 874 aa  525  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2338  hypothetical protein  38.71 
 
 		 874 aa  511  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000220057  unclonable  0.000000361106 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1272  hypothetical protein  38.6 
 
 		 874 aa  509  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1363  SMC protein-like  32.51 
 
 		 875 aa  452  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.922778  normal  0.196985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1830  hypothetical protein  25.94 
 
 		 955 aa  157  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  25.6 
 
 		 808 aa  58.9  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1085  DNA repair ATPase-like protein  26.16 
 
 		 741 aa  58.5  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0841172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1161  hypothetical protein  35.29 
 
 		 800 aa  49.3  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  29.29 
 
 		 868 aa  47.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  38.89 
 
 		 874 aa  47.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  31.93 
 
 		 844 aa  47  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2588  SMC domain protein  37.74 
 
 		 687 aa  47  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326587  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  33.96 
 
 		 682 aa  46.2  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  36.11 
 
 		 849 aa  45.8  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  31.76 
 
 		 896 aa  45.8  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  32.17 
 
 		 872 aa  44.7  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  21.83 
 
 		 796 aa  44.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>