19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2338 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1420  hypothetical protein  74.49 
 
 		 874 aa  1332    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0450  SMC domain protein  59.31 
 
 		 877 aa  1046    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1272  hypothetical protein  99.43 
 
 		 874 aa  1759    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2338  hypothetical protein  100 
 
 		 874 aa  1764    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000220057  unclonable  0.000000361106 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5366  hypothetical protein  38.71 
 
 		 892 aa  499  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.0115994 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1363  SMC protein-like  32.03 
 
 		 875 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.922778  normal  0.196985 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3707  SMC domain-containing protein  36.32 
 
 		 881 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3982  hypothetical protein  35.66 
 
 		 881 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0815711  hitchhiker  0.00348599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1830  hypothetical protein  27.21 
 
 		 955 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  26.44 
 
 		 808 aa  54.7  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2588  SMC domain protein  41.51 
 
 		 687 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326587  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  39.62 
 
 		 682 aa  49.3  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  27.08 
 
 		 872 aa  47.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  30 
 
 		 874 aa  46.2  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.84 
 
 		 634 aa  45.8  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  37.93 
 
 		 796 aa  45.8  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  37.84 
 
 		 849 aa  45.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  31.63 
 
 		 844 aa  45.4  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0173  hypothetical protein  28.79 
 
 		 729 aa  45.4  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>