17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0450 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1420  hypothetical protein  57.75 
 
 		 874 aa  990    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0450  SMC domain protein  100 
 
 		 877 aa  1800    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1272  hypothetical protein  59.31 
 
 		 874 aa  1045    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2338  hypothetical protein  59.31 
 
 		 874 aa  1046    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000220057  unclonable  0.000000361106 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5366  hypothetical protein  38.13 
 
 		 892 aa  528  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.0115994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3982  hypothetical protein  35.87 
 
 		 881 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0815711  hitchhiker  0.00348599 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3707  SMC domain-containing protein  35.18 
 
 		 881 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1363  SMC protein-like  33.3 
 
 		 875 aa  480  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.922778  normal  0.196985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1830  hypothetical protein  26.52 
 
 		 955 aa  164  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1085  DNA repair ATPase-like protein  28.57 
 
 		 741 aa  57.4  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0841172  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  26.32 
 
 		 808 aa  54.7  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  26 
 
 		 682 aa  50.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  25.31 
 
 		 796 aa  50.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  25.25 
 
 		 872 aa  47  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2588  SMC domain protein  37.93 
 
 		 687 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326587  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2963  DNA repair ATPase-like protein  40.91 
 
 		 929 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  38.71 
 
 		 844 aa  45.1  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>