28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3707 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3707  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 881 aa  1807    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5366  hypothetical protein  49.55 
 
 		 892 aa  848    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.0115994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3982  hypothetical protein  63.45 
 
 		 881 aa  1130    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0815711  hitchhiker  0.00348599 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0450  SMC domain protein  35.18 
 
 		 877 aa  495  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1420  hypothetical protein  37.13 
 
 		 874 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2338  hypothetical protein  36.32 
 
 		 874 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000220057  unclonable  0.000000361106 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1272  hypothetical protein  36.1 
 
 		 874 aa  462  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1363  SMC protein-like  31.72 
 
 		 875 aa  389  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.922778  normal  0.196985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1830  hypothetical protein  25.03 
 
 		 955 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  33.65 
 
 		 868 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1085  DNA repair ATPase-like protein  28.44 
 
 		 741 aa  53.5  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0841172  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  38.1 
 
 		 682 aa  52.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  39.44 
 
 		 874 aa  50.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  36.47 
 
 		 896 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  33.72 
 
 		 869 aa  47.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2588  SMC domain protein  40.38 
 
 		 687 aa  47.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326587  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  35.29 
 
 		 808 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  37.1 
 
 		 810 aa  45.8  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  29.21 
 
 		 872 aa  45.8  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1580  SMC domain protein  29.17 
 
 		 818 aa  45.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.338996  normal  0.282314 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  47.62 
 
 		 849 aa  45.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  21.81 
 
 		 844 aa  45.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  40.62 
 
 		 812 aa  45.4  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2291  ATPase  43.55 
 
 		 566 aa  44.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  22.79 
 
 		 1134 aa  44.3  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  41.94 
 
 		 812 aa  44.3  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1170  ATPase AAA-2  43.55 
 
 		 949 aa  44.3  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.501064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3413  ATPase  43.55 
 
 		 949 aa  44.3  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0114965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>