19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1272 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_1420  hypothetical protein  74.83 
 
 
874 aa  1337    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542957  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0450  SMC domain protein  59.31 
 
 
877 aa  1045    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292453  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1272  hypothetical protein  100 
 
 
874 aa  1768    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2338  hypothetical protein  99.43 
 
 
874 aa  1759    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000220057  unclonable  0.000000361106 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5366  hypothetical protein  38.6 
 
 
892 aa  498  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.0115994 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1363  SMC protein-like  31.61 
 
 
875 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.922778  normal  0.196985 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3707  SMC domain-containing protein  36.1 
 
 
881 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3982  hypothetical protein  35.55 
 
 
881 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0815711  hitchhiker  0.00348599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1830  hypothetical protein  27.35 
 
 
955 aa  169  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  25.86 
 
 
808 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2588  SMC domain protein  41.51 
 
 
687 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326587  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  39.62 
 
 
682 aa  49.3  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  27.08 
 
 
872 aa  47.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  30 
 
 
874 aa  46.2  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.84 
 
 
634 aa  45.8  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  37.93 
 
 
796 aa  45.8  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  37.84 
 
 
849 aa  45.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  31.63 
 
 
844 aa  45.4  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0173  hypothetical protein  28.79 
 
 
729 aa  45.4  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>