12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1161 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1161  hypothetical protein  100 
 
 		 800 aa  1602    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1580  SMC domain protein  20.24 
 
 		 818 aa  127  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.338996  normal  0.282314 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1085  DNA repair ATPase-like protein  25.07 
 
 		 741 aa  66.6  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0841172  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0690  hypothetical protein  37.33 
 
 		 550 aa  60.1  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.372164  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1587  hypothetical protein  37.33 
 
 		 550 aa  60.1  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.820969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1830  hypothetical protein  36.71 
 
 		 955 aa  57.8  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5366  hypothetical protein  35.29 
 
 		 892 aa  49.3  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.0115994 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  41.18 
 
 		 796 aa  48.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2913  hypothetical protein  25.45 
 
 		 517 aa  47.8  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3982  hypothetical protein  36 
 
 		 881 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0815711  hitchhiker  0.00348599 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  22.36 
 
 		 795 aa  45.1  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  30.19 
 
 		 808 aa  44.3  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>