25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1580 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1580  SMC domain protein  100 
 
 		 818 aa  1686    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.338996  normal  0.282314 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1161  hypothetical protein  20.24 
 
 		 800 aa  129  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.36 
 
 		 647 aa  51.2  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2588  SMC domain protein  42.59 
 
 		 687 aa  47.8  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326587  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  42.86 
 
 		 808 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  42.86 
 
 		 682 aa  47  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0883  hypothetical protein  43.86 
 
 		 79 aa  45.8  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2374  hypothetical protein  35.06 
 
 		 579 aa  45.8  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16066  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  28.36 
 
 		 1195 aa  45.8  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3707  SMC domain-containing protein  29.17 
 
 		 881 aa  45.4  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  26.72 
 
 		 896 aa  45.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  27.27 
 
 		 1142 aa  45.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  28.68 
 
 		 1138 aa  45.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  28.68 
 
 		 1138 aa  45.1  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  28.68 
 
 		 1138 aa  45.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  27.27 
 
 		 1145 aa  45.1  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  28.68 
 
 		 1138 aa  45.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  27.27 
 
 		 1142 aa  45.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  27.27 
 
 		 1142 aa  44.7  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  47.73 
 
 		 362 aa  44.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5366  hypothetical protein  23.25 
 
 		 892 aa  44.7  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.0115994 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  27.27 
 
 		 1145 aa  44.7  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 		 1191 aa  44.3  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1830  hypothetical protein  27.69 
 
 		 955 aa  44.3  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  30.1 
 
 		 872 aa  44.3  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>