277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0905 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  42.49 
 
 		 1023 aa  703    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 1022 aa  2008    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  81.29 
 
 		 1022 aa  1560    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  40.55 
 
 		 1031 aa  630  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  32.94 
 
 		 859 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  33.02 
 
 		 1008 aa  415  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  33.82 
 
 		 1019 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  31.66 
 
 		 1003 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  31.09 
 
 		 1007 aa  385  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  28.91 
 
 		 1016 aa  382  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  29.16 
 
 		 1008 aa  347  6e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  29.16 
 
 		 1008 aa  346  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  37.08 
 
 		 859 aa  267  7e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  44.41 
 
 		 859 aa  248  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  28.66 
 
 		 1007 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  33.13 
 
 		 857 aa  160  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  25.73 
 
 		 906 aa  134  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  22.13 
 
 		 1018 aa  116  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  31.08 
 
 		 895 aa  109  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  21.92 
 
 		 1029 aa  108  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  30.48 
 
 		 891 aa  107  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  20.27 
 
 		 993 aa  105  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  21.65 
 
 		 1029 aa  105  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  20.37 
 
 		 993 aa  105  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  28.16 
 
 		 924 aa  103  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  19.01 
 
 		 1009 aa  103  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  24.65 
 
 		 1061 aa  101  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  22.71 
 
 		 1011 aa  101  9e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  32.8 
 
 		 910 aa  100  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  21.68 
 
 		 1018 aa  100  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  22.58 
 
 		 891 aa  99.8  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  20.39 
 
 		 993 aa  98.6  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  19.62 
 
 		 1019 aa  97.1  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  29.49 
 
 		 902 aa  94.7  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  26.54 
 
 		 1057 aa  92.8  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  25.62 
 
 		 994 aa  92  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  29.64 
 
 		 890 aa  88.6  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  31.25 
 
 		 824 aa  87.4  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  33.96 
 
 		 1029 aa  82  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  24.4 
 
 		 693 aa  80.5  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  27.11 
 
 		 1030 aa  80.5  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  24.45 
 
 		 1029 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  32.7 
 
 		 1029 aa  79  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  32.7 
 
 		 1029 aa  79  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  35.77 
 
 		 1018 aa  79.3  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2563  exonuclease SbcC  32.62 
 
 		 1000 aa  78.6  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.679449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  32.34 
 
 		 904 aa  78.2  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  34.15 
 
 		 1018 aa  78.2  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  34.96 
 
 		 1018 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  32.08 
 
 		 1029 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  32.08 
 
 		 1029 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  27.32 
 
 		 815 aa  77.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  27.76 
 
 		 961 aa  77.8  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  33.33 
 
 		 1018 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  32.5 
 
 		 1013 aa  77  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  31.19 
 
 		 1103 aa  76.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  27.85 
 
 		 810 aa  76.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  29.79 
 
 		 789 aa  75.5  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  35 
 
 		 1018 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  36.19 
 
 		 1214 aa  75.1  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  26.44 
 
 		 1032 aa  74.7  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  36.19 
 
 		 1214 aa  75.1  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  36.19 
 
 		 1214 aa  74.7  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  36.19 
 
 		 1214 aa  75.1  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  30.39 
 
 		 1247 aa  74.7  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  32.52 
 
 		 1018 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  34.29 
 
 		 1213 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  35.24 
 
 		 1211 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  32.26 
 
 		 1020 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  35.24 
 
 		 1211 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  23.02 
 
 		 978 aa  73.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  35.24 
 
 		 1214 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  29.38 
 
 		 824 aa  73.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  35.24 
 
 		 1214 aa  72.4  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  30.13 
 
 		 881 aa  72  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 1234 aa  72  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  29.53 
 
 		 1232 aa  71.6  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  23.71 
 
 		 1049 aa  71.2  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  27.41 
 
 		 1155 aa  70.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  24.02 
 
 		 1021 aa  70.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 		 1346 aa  70.5  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  28.5 
 
 		 1226 aa  69.7  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  29.15 
 
 		 1074 aa  69.3  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  26.61 
 
 		 1232 aa  69.7  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  32 
 
 		 1020 aa  69.7  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  29.72 
 
 		 1165 aa  69.3  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0859  exonuclease SbcC  26.83 
 
 		 950 aa  68.6  0.0000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  37.23 
 
 		 1101 aa  68.6  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  28.25 
 
 		 851 aa  68.2  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  31.9 
 
 		 1038 aa  68.2  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  29.21 
 
 		 1144 aa  67.8  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  32.61 
 
 		 1085 aa  67.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  26.19 
 
 		 1227 aa  66.6  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  27.19 
 
 		 1091 aa  67  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  31.08 
 
 		 1039 aa  66.6  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  27.61 
 
 		 995 aa  67  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  26.46 
 
 		 1009 aa  66.2  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  29.95 
 
 		 1017 aa  66.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  30.05 
 
 		 955 aa  65.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  25.23 
 
 		 1227 aa  66.2  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>