More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3541 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  54.07 
 
 		 1007 aa  971    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  100 
 
 		 1003 aa  1965    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  49.65 
 
 		 1007 aa  876    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  57.04 
 
 		 1008 aa  1038    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  50.79 
 
 		 1016 aa  955    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  47.07 
 
 		 1008 aa  810    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  47.07 
 
 		 1008 aa  811    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  31.98 
 
 		 1022 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  33.49 
 
 		 1019 aa  393  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  31.37 
 
 		 1031 aa  375  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  32.29 
 
 		 1022 aa  369  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  29.54 
 
 		 859 aa  348  2e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  29.32 
 
 		 859 aa  333  7.000000000000001e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  33.64 
 
 		 1023 aa  242  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  35.79 
 
 		 859 aa  193  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2563  exonuclease SbcC  36.61 
 
 		 1000 aa  164  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.679449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  46.91 
 
 		 857 aa  157  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  22.16 
 
 		 891 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  33.07 
 
 		 910 aa  112  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  29.35 
 
 		 961 aa  109  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  31.07 
 
 		 924 aa  106  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  19.35 
 
 		 993 aa  105  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  31.54 
 
 		 895 aa  102  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  24.3 
 
 		 1029 aa  101  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  32.41 
 
 		 902 aa  99.8  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  20.45 
 
 		 864 aa  99.4  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  21.38 
 
 		 994 aa  99  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  28.33 
 
 		 891 aa  93.6  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  26.81 
 
 		 890 aa  92.8  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  29.26 
 
 		 906 aa  84.7  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  31.21 
 
 		 1227 aa  84.7  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  27.44 
 
 		 1074 aa  84  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  32.3 
 
 		 1227 aa  84  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  30 
 
 		 824 aa  82.4  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  23.58 
 
 		 1018 aa  82  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  27.57 
 
 		 978 aa  81.3  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  33.14 
 
 		 912 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  30.49 
 
 		 1232 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  20.53 
 
 		 1009 aa  80.1  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  35.64 
 
 		 851 aa  77.8  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  25.57 
 
 		 904 aa  77.4  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  24.4 
 
 		 693 aa  77.8  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  22.16 
 
 		 1029 aa  76.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  21.59 
 
 		 1029 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  23.54 
 
 		 987 aa  75.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  28.64 
 
 		 1011 aa  75.9  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  29.59 
 
 		 815 aa  75.5  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  30.1 
 
 		 1229 aa  74.7  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  30.1 
 
 		 1229 aa  74.7  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  30.1 
 
 		 1220 aa  74.7  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  31.2 
 
 		 1018 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  31.2 
 
 		 1018 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  31.2 
 
 		 1018 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  26.44 
 
 		 993 aa  73.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  31.2 
 
 		 1018 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  21.68 
 
 		 1029 aa  72.8  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  26.36 
 
 		 922 aa  72.8  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  25.55 
 
 		 1247 aa  72.8  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  31.2 
 
 		 1018 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  23.25 
 
 		 789 aa  72.8  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  32.32 
 
 		 1165 aa  72.4  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  25.98 
 
 		 1099 aa  72  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  22.8 
 
 		 1021 aa  71.6  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  24.3 
 
 		 1061 aa  71.6  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  25.81 
 
 		 858 aa  71.2  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  27.11 
 
 		 852 aa  71.2  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  27.11 
 
 		 852 aa  71.2  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  24.05 
 
 		 987 aa  71.2  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  28.45 
 
 		 1227 aa  70.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  31.2 
 
 		 1018 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  30.4 
 
 		 1018 aa  71.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  31.2 
 
 		 1018 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  31.2 
 
 		 1018 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  22.62 
 
 		 1029 aa  69.7  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  22.83 
 
 		 1029 aa  69.7  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  28.37 
 
 		 1232 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  25.14 
 
 		 1308 aa  69.3  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  30.4 
 
 		 1018 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  28.64 
 
 		 824 aa  69.3  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  30.98 
 
 		 1116 aa  68.9  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  28.03 
 
 		 1346 aa  68.6  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  24.47 
 
 		 1029 aa  66.6  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  30.32 
 
 		 1042 aa  67  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  30.57 
 
 		 1022 aa  66.6  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  24.47 
 
 		 1029 aa  66.6  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  29.6 
 
 		 1018 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  25.44 
 
 		 1234 aa  66.6  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  24.39 
 
 		 702 aa  67  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  30.47 
 
 		 1020 aa  66.2  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  28.44 
 
 		 1227 aa  65.9  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  29.03 
 
 		 1018 aa  65.5  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  33 
 
 		 881 aa  65.1  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  26.41 
 
 		 700 aa  64.7  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2237  putative DNA repair ATPase  26.2 
 
 		 820 aa  64.7  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.079976 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  23.77 
 
 		 1108 aa  64.7  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  27.16 
 
 		 995 aa  64.3  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  30.53 
 
 		 1114 aa  63.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  22.22 
 
 		 935 aa  63.2  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.17 
 
 		 1177 aa  62.8  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  29.37 
 
 		 1013 aa  62.4  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>