124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0018 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0018  SMC domain protein  100 
 
 		 862 aa  1734    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0623828 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1213  SMC domain-containing protein  27.38 
 
 		 806 aa  285  3.0000000000000004e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  51.92 
 
 		 802 aa  169  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  22.77 
 
 		 891 aa  87.8  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  22.28 
 
 		 926 aa  79.7  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  31.52 
 
 		 1021 aa  77.8  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  22.77 
 
 		 812 aa  68.6  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  36.96 
 
 		 987 aa  63.9  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  27.77 
 
 		 924 aa  63.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  36.96 
 
 		 987 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  35.29 
 
 		 895 aa  62.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  30.1 
 
 		 1020 aa  62.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  30.65 
 
 		 1116 aa  62.4  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  33.79 
 
 		 891 aa  62  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  37.36 
 
 		 984 aa  60.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  29.1 
 
 		 1114 aa  59.7  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  37.63 
 
 		 814 aa  58.2  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  30.46 
 
 		 851 aa  58.2  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  26.44 
 
 		 993 aa  57.4  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  29.61 
 
 		 1029 aa  57.4  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  35.05 
 
 		 1019 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  25.71 
 
 		 993 aa  56.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  25.71 
 
 		 993 aa  57  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  26.78 
 
 		 840 aa  55.8  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  27.17 
 
 		 1180 aa  55.8  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  31.11 
 
 		 1190 aa  55.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  27.55 
 
 		 1074 aa  54.3  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  36.84 
 
 		 815 aa  54.3  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  33.7 
 
 		 813 aa  53.9  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  26.94 
 
 		 1017 aa  54.3  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  26.9 
 
 		 858 aa  53.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  27.42 
 
 		 1081 aa  52.8  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  26.15 
 
 		 1215 aa  52.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  25.29 
 
 		 994 aa  52  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1216  SMC domain protein  26.09 
 
 		 531 aa  52  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  22.59 
 
 		 978 aa  51.6  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  30.64 
 
 		 1029 aa  51.2  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  30.64 
 
 		 1029 aa  51.6  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  30.64 
 
 		 1029 aa  51.2  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  29.8 
 
 		 1223 aa  51.6  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  30.64 
 
 		 1029 aa  51.2  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  30.64 
 
 		 1029 aa  51.2  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  22.66 
 
 		 1032 aa  51.2  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  30.06 
 
 		 1029 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  37.5 
 
 		 558 aa  50.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  30.23 
 
 		 1029 aa  50.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  30.06 
 
 		 1029 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  37.5 
 
 		 557 aa  50.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  35 
 
 		 1146 aa  50.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1551  SMC domain-containing protein  30 
 
 		 1074 aa  50.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625316 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  27.43 
 
 		 1057 aa  50.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3138  ABC transporter related  32.59 
 
 		 621 aa  50.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00577211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  24 
 
 		 789 aa  49.7  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  27.22 
 
 		 1019 aa  49.7  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  32.63 
 
 		 693 aa  49.3  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  27.93 
 
 		 1029 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  31.63 
 
 		 1099 aa  48.9  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  29.85 
 
 		 888 aa  48.9  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  37.68 
 
 		 561 aa  48.9  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  34.48 
 
 		 557 aa  48.5  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  22.33 
 
 		 1164 aa  48.5  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  30.06 
 
 		 1029 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  29.53 
 
 		 1198 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  35.94 
 
 		 557 aa  48.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  23.89 
 
 		 804 aa  48.1  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  40.35 
 
 		 1174 aa  48.5  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  39.47 
 
 		 784 aa  48.1  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  44 
 
 		 918 aa  48.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  37.93 
 
 		 561 aa  47.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  39.66 
 
 		 561 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  37.93 
 
 		 561 aa  47.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  34.83 
 
 		 910 aa  47.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  24.78 
 
 		 1061 aa  47.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  27.88 
 
 		 906 aa  47.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  25.19 
 
 		 556 aa  47  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2553  SMC domain protein  29.46 
 
 		 829 aa  47.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  37.93 
 
 		 565 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  25.42 
 
 		 1204 aa  47.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 557 aa  47.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  41.51 
 
 		 758 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  30.56 
 
 		 572 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1738  ABC transporter related  38.75 
 
 		 793 aa  46.6  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1785  ABC transporter related  38.75 
 
 		 793 aa  46.6  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.806156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1717  ABC transporter related  38.75 
 
 		 793 aa  47  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  37.93 
 
 		 557 aa  46.6  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  32.22 
 
 		 1023 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  29.45 
 
 		 1170 aa  46.6  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  26 
 
 		 1165 aa  46.6  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  26.37 
 
 		 1108 aa  46.6  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  28.32 
 
 		 902 aa  46.6  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  26.74 
 
 		 810 aa  46.2  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  25.12 
 
 		 1029 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  36.11 
 
 		 1011 aa  46.2  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  34.72 
 
 		 557 aa  45.8  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1341  ABC transporter ATP-binding protein  36.28 
 
 		 645 aa  45.8  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.282771  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1276  ABC transporter related  36.28 
 
 		 645 aa  45.8  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  28.33 
 
 		 1030 aa  45.8  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19031  DNA repair protein RecN, ABC transporter  35.23 
 
 		 559 aa  45.8  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.298461  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0298  DNA repair protein RecN  21.7 
 
 		 506 aa  45.8  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  31.78 
 
 		 1148 aa  45.4  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>