158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4848 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  72.8 
 
 		 626 aa  939    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 		 626 aa  1281    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  43.37 
 
 		 648 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  30.9 
 
 		 681 aa  224  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  29.93 
 
 		 663 aa  213  7.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  65.25 
 
 		 159 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  28.15 
 
 		 653 aa  165  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.09 
 
 		 589 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  24.25 
 
 		 564 aa  101  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.21 
 
 		 607 aa  96.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.83 
 
 		 591 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  24.18 
 
 		 564 aa  93.6  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  25.79 
 
 		 604 aa  87.8  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.95 
 
 		 605 aa  84  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  23.18 
 
 		 579 aa  82.8  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  25.12 
 
 		 513 aa  81.6  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.04 
 
 		 603 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  21.31 
 
 		 714 aa  76.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.05 
 
 		 640 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  24.06 
 
 		 505 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  22.22 
 
 		 607 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.73 
 
 		 595 aa  75.1  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.49 
 
 		 647 aa  72  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  23.32 
 
 		 586 aa  67.8  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.4 
 
 		 594 aa  66.2  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  25.29 
 
 		 695 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.59 
 
 		 616 aa  65.1  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  28.31 
 
 		 641 aa  65.1  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  29.02 
 
 		 619 aa  64.3  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.99 
 
 		 674 aa  62.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  22.51 
 
 		 603 aa  62  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.23 
 
 		 566 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  23.42 
 
 		 688 aa  60.5  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.96 
 
 		 573 aa  60.5  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  28.5 
 
 		 598 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  21.85 
 
 		 606 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  25 
 
 		 628 aa  58.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  51.16 
 
 		 680 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  30.16 
 
 		 598 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.09 
 
 		 608 aa  55.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.27 
 
 		 669 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3650  hypothetical protein  53.06 
 
 		 426 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574815  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  27.1 
 
 		 598 aa  53.9  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.8 
 
 		 613 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.33 
 
 		 634 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02258  hypothetical protein  34.51 
 
 		 626 aa  53.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  23.36 
 
 		 728 aa  52.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  42.25 
 
 		 667 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  20.71 
 
 		 584 aa  51.2  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 645 aa  51.2  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.45 
 
 		 793 aa  51.2  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  19.5 
 
 		 642 aa  51.2  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  25.14 
 
 		 642 aa  50.4  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  29.61 
 
 		 807 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  27.64 
 
 		 650 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  28.32 
 
 		 758 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0144  putative RecF protein  30 
 
 		 132 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  38.33 
 
 		 347 aa  49.7  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  36.67 
 
 		 497 aa  49.7  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  31.22 
 
 		 543 aa  48.9  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  46.51 
 
 		 369 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  36.23 
 
 		 645 aa  48.5  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3452  hypothetical protein  30.36 
 
 		 519 aa  48.5  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  27.03 
 
 		 771 aa  48.9  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  25.57 
 
 		 553 aa  48.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1975  hypothetical protein  27.51 
 
 		 554 aa  48.1  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.650483  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  23.22 
 
 		 707 aa  48.1  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54192  predicted protein  34.67 
 
 		 1099 aa  47.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0618  hypothetical protein  29.85 
 
 		 578 aa  47.8  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.508373  normal  0.13002 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1750  SMC domain protein  27.78 
 
 		 445 aa  47.8  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.524117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.94 
 
 		 708 aa  47.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  25 
 
 		 696 aa  47.8  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.48 
 
 		 578 aa  47.4  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  36.73 
 
 		 483 aa  47.8  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  39.58 
 
 		 514 aa  47.4  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0571  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.09 
 
 		 614 aa  47.4  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  38.03 
 
 		 422 aa  47.4  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  31.71 
 
 		 442 aa  47.4  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  35.11 
 
 		 416 aa  47  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  27.04 
 
 		 623 aa  47  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  39.58 
 
 		 1181 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1891  SMC domain protein  20.93 
 
 		 628 aa  47  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2963  DNA repair ATPase-like protein  33.33 
 
 		 929 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  35.56 
 
 		 993 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  38 
 
 		 339 aa  47  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  35.56 
 
 		 993 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  23.08 
 
 		 708 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  38.89 
 
 		 634 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  37.5 
 
 		 1164 aa  46.2  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  21.31 
 
 		 666 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  24.58 
 
 		 780 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  33.33 
 
 		 763 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  47.06 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  36.62 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1317  hypothetical protein  39.13 
 
 		 388 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.361107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  36.36 
 
 		 409 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  39.58 
 
 		 1141 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  35.56 
 
 		 993 aa  46.6  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  42.22 
 
 		 994 aa  46.2  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  42.5 
 
 		 392 aa  46.2  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>