43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2627 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  710    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  54.84 
 
 		 571 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1772  hypothetical protein  41.72 
 
 		 573 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755026  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  41.09 
 
 		 565 aa  249  7e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0282  AAA ATPase  39.41 
 
 		 378 aa  225  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  28.74 
 
 		 583 aa  146  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  27.84 
 
 		 580 aa  142  9e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2274  AAA ATPase  26.61 
 
 		 602 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.363979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  25 
 
 		 595 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1107  hypothetical protein  24.32 
 
 		 591 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000952777  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  21.49 
 
 		 680 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  23.3 
 
 		 572 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  41.67 
 
 		 626 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.33 
 
 		 626 aa  49.7  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  54.35 
 
 		 762 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  39.44 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.94 
 
 		 647 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  28.28 
 
 		 653 aa  47.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  37.5 
 
 		 369 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  28.72 
 
 		 566 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  40.82 
 
 		 773 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  46.94 
 
 		 782 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  30.77 
 
 		 670 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  21.77 
 
 		 634 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0456  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.47 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  22.16 
 
 		 378 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  44.19 
 
 		 807 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  29.63 
 
 		 263 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.76 
 
 		 578 aa  44.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  31.9 
 
 		 1153 aa  44.3  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1664  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.93 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  48.84 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  30.43 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  33.8 
 
 		 428 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1541  hypothetical protein  41.3 
 
 		 131 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0141757 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  42.62 
 
 		 244 aa  43.5  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0348  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.53 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3650  hypothetical protein  42.31 
 
 		 426 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574815  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.39 
 
 		 386 aa  42.7  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  45.45 
 
 		 388 aa  42.7  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5288  SMC domain protein  39.13 
 
 		 610 aa  42.7  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  29.21 
 
 		 429 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>