202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0137 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  100 
 
 		 666 aa  1323    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  42.88 
 
 		 652 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.18 
 
 		 642 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  21.48 
 
 		 681 aa  94.4  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  25.58 
 
 		 529 aa  93.2  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.89 
 
 		 603 aa  92.8  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.11 
 
 		 613 aa  93.2  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  21.91 
 
 		 594 aa  87.4  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  25.12 
 
 		 688 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  23.55 
 
 		 584 aa  82.8  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  21.85 
 
 		 596 aa  81.6  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  22.8 
 
 		 613 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.16 
 
 		 605 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.54 
 
 		 607 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  24.35 
 
 		 566 aa  77.4  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.49 
 
 		 616 aa  77.4  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.54 
 
 		 591 aa  74.3  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0571  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.82 
 
 		 614 aa  74.3  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.47 
 
 		 573 aa  73.9  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.26 
 
 		 608 aa  73.6  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  22.61 
 
 		 669 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  25.05 
 
 		 594 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.33 
 
 		 548 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.87 
 
 		 708 aa  72  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  24.35 
 
 		 623 aa  72.4  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  20.86 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  24.62 
 
 		 564 aa  71.2  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  21.23 
 
 		 634 aa  71.2  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  22.46 
 
 		 682 aa  70.9  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  24.51 
 
 		 685 aa  68.9  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  22.8 
 
 		 674 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  29.17 
 
 		 628 aa  66.6  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.05 
 
 		 637 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  24.7 
 
 		 513 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  25.09 
 
 		 581 aa  65.1  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  22.42 
 
 		 712 aa  65.1  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  20.76 
 
 		 564 aa  63.5  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.37 
 
 		 640 aa  63.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  21.11 
 
 		 598 aa  62.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.83 
 
 		 595 aa  62  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  20.16 
 
 		 695 aa  62  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  30.29 
 
 		 596 aa  60.8  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  25.16 
 
 		 586 aa  60.8  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  23.06 
 
 		 645 aa  60.1  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  26.96 
 
 		 574 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  30.73 
 
 		 497 aa  58.9  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  28.78 
 
 		 650 aa  58.5  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  19.95 
 
 		 669 aa  57.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  23.94 
 
 		 607 aa  57.8  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  21.48 
 
 		 553 aa  57.4  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  20.55 
 
 		 667 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.38 
 
 		 672 aa  56.6  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  29.71 
 
 		 593 aa  57  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  23.03 
 
 		 600 aa  55.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  25.35 
 
 		 653 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.96 
 
 		 639 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4877  AAA ATPase  33.62 
 
 		 591 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0546065  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  26.56 
 
 		 771 aa  56.2  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.37 
 
 		 578 aa  55.8  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  29.34 
 
 		 758 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  31.58 
 
 		 508 aa  55.8  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0681  hypothetical protein  24.18 
 
 		 619 aa  55.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  28.49 
 
 		 643 aa  55.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  26.02 
 
 		 641 aa  55.1  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  27.92 
 
 		 703 aa  54.7  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  26.5 
 
 		 634 aa  54.3  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.02 
 
 		 615 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0196  hypothetical protein  20.28 
 
 		 654 aa  54.3  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  22.47 
 
 		 427 aa  53.5  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  26.43 
 
 		 641 aa  53.5  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05008  hypothetical protein  34.03 
 
 		 658 aa  53.5  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  28 
 
 		 369 aa  52.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1872  hypothetical protein  28.15 
 
 		 585 aa  52.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  21.58 
 
 		 604 aa  52.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  23.14 
 
 		 439 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.03 
 
 		 608 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.88 
 
 		 669 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  26.34 
 
 		 495 aa  52.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.84 
 
 		 677 aa  52.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.84 
 
 		 677 aa  52.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.89 
 
 		 589 aa  52  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  27.78 
 
 		 486 aa  51.6  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0454  AAA ATPase  31.07 
 
 		 606 aa  51.6  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.56 
 
 		 615 aa  51.2  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  22.63 
 
 		 579 aa  51.6  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.81 
 
 		 582 aa  51.2  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  26.58 
 
 		 626 aa  50.8  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  37.04 
 
 		 1167 aa  50.4  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  22.86 
 
 		 452 aa  50.8  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  42.22 
 
 		 496 aa  50.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  25 
 
 		 680 aa  50.4  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  27.27 
 
 		 408 aa  50.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.68 
 
 		 550 aa  50.4  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  20.76 
 
 		 580 aa  50.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  25.95 
 
 		 603 aa  50.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  27.27 
 
 		 429 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  27.12 
 
 		 773 aa  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  34.33 
 
 		 670 aa  50.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  23.23 
 
 		 619 aa  50.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  26.88 
 
 		 598 aa  49.7  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>