152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3363 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  100 
 
 		 607 aa  1248    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.18 
 
 		 594 aa  383  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.68 
 
 		 640 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  27 
 
 		 647 aa  113  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  25.05 
 
 		 598 aa  103  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  24.6 
 
 		 669 aa  101  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  25.42 
 
 		 613 aa  97.4  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0201  ATP-dependent endonuclease of the OLD family protein  24.1 
 
 		 558 aa  97.1  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  22.2 
 
 		 650 aa  96.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  23.85 
 
 		 685 aa  94.4  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  23.79 
 
 		 543 aa  93.6  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  24.45 
 
 		 564 aa  90.9  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  31.01 
 
 		 703 aa  89  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  22.54 
 
 		 596 aa  88.6  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  24.39 
 
 		 594 aa  88.2  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  27.54 
 
 		 667 aa  87  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  25.68 
 
 		 674 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  23.75 
 
 		 544 aa  85.1  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  24.64 
 
 		 594 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  24.63 
 
 		 623 aa  84.3  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.98 
 
 		 566 aa  84  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.96 
 
 		 613 aa  84  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.57 
 
 		 674 aa  83.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.44 
 
 		 639 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2614  hypothetical protein  23.26 
 
 		 555 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1594  hypothetical protein  23.26 
 
 		 555 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2699  hypothetical protein  23.26 
 
 		 555 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  25.68 
 
 		 634 aa  80.5  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  22.91 
 
 		 574 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1709  hypothetical protein  25.65 
 
 		 554 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.137419  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  22.73 
 
 		 758 aa  77  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  28.08 
 
 		 712 aa  77.4  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1975  hypothetical protein  21.71 
 
 		 554 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.650483  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.22 
 
 		 626 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.01 
 
 		 595 aa  75.5  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  22.37 
 
 		 626 aa  75.1  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  24.13 
 
 		 553 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  22.89 
 
 		 659 aa  75.1  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2370  hypothetical protein  22.79 
 
 		 553 aa  74.3  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  24.6 
 
 		 657 aa  74.3  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 645 aa  73.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  22.59 
 
 		 661 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  23.36 
 
 		 554 aa  72  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  23.95 
 
 		 604 aa  70.5  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1393  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.21 
 
 		 552 aa  70.1  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  22.69 
 
 		 565 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2270  hypothetical protein  22.2 
 
 		 553 aa  70.1  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  25.2 
 
 		 579 aa  69.3  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.1 
 
 		 605 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5288  SMC domain protein  22.18 
 
 		 610 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  22.86 
 
 		 648 aa  68.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  28.64 
 
 		 554 aa  68.2  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  25.72 
 
 		 604 aa  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  23.53 
 
 		 645 aa  65.5  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0950  hypothetical protein  25.47 
 
 		 552 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.714273  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2283  hypothetical protein  25.47 
 
 		 552 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0243665  normal  0.014671 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2452  hypothetical protein  25.47 
 
 		 552 aa  65.1  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234891  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00881  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  25.59 
 
 		 552 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2766  conserved hypothetical protein  25.59 
 
 		 552 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1006  hypothetical protein  25.47 
 
 		 552 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1038  hypothetical protein  25.47 
 
 		 552 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0940  hypothetical protein  25.47 
 
 		 552 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0974  conserved protein nucleotide triphosphate hydrolase domain  25.47 
 
 		 552 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.120281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1057  conserved protein, nucleotide triphosphate hydrolase domain protein  25.47 
 
 		 552 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00887  hypothetical protein  25.59 
 
 		 552 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0980  hypothetical protein  25.59 
 
 		 552 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.37 
 
 		 607 aa  65.1  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2720  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.59 
 
 		 552 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1037  hypothetical protein  25.47 
 
 		 552 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.33 
 
 		 689 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05915  hypothetical protein  26.09 
 
 		 544 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  27.85 
 
 		 695 aa  60.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  26.44 
 
 		 707 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  21.62 
 
 		 600 aa  59.7  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  27.36 
 
 		 663 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  26.32 
 
 		 682 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  22.85 
 
 		 728 aa  58.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.11 
 
 		 669 aa  57.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  24.79 
 
 		 744 aa  58.2  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  23.94 
 
 		 666 aa  57.8  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  30.1 
 
 		 691 aa  57.8  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.35 
 
 		 642 aa  57  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.51 
 
 		 677 aa  57  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.51 
 
 		 677 aa  57  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  33.62 
 
 		 564 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  25.54 
 
 		 628 aa  55.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0196  ATPase  25.7 
 
 		 666 aa  55.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.26 
 
 		 616 aa  55.5  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.24 
 
 		 652 aa  54.7  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.38 
 
 		 634 aa  54.3  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  45.76 
 
 		 610 aa  54.3  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  22.2 
 
 		 748 aa  54.3  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  25 
 
 		 773 aa  54.3  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  22.83 
 
 		 688 aa  53.9  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  25.6 
 
 		 696 aa  53.5  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.29 
 
 		 637 aa  53.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  23.88 
 
 		 762 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.44 
 
 		 615 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  25.38 
 
 		 537 aa  52.8  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.95 
 
 		 608 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>