73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1873 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  832    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  57.99 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  54.93 
 
 		 429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  33.41 
 
 		 465 aa  205  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  31.75 
 
 		 464 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  31.88 
 
 		 466 aa  195  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  31.07 
 
 		 465 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  27.29 
 
 		 459 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  24.89 
 
 		 457 aa  113  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  27.46 
 
 		 459 aa  110  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  23.11 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  27.51 
 
 		 451 aa  93.6  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  24.49 
 
 		 374 aa  92.8  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  31.48 
 
 		 478 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  29.41 
 
 		 527 aa  89  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  24.57 
 
 		 374 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  28.93 
 
 		 617 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  25.13 
 
 		 467 aa  82.8  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  31.94 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  26.75 
 
 		 514 aa  72.8  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  27.92 
 
 		 555 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  33.82 
 
 		 565 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  23.61 
 
 		 508 aa  70.1  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  33.63 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  27.61 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  30.36 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  22.6 
 
 		 391 aa  67  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  32.08 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  31.86 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  31.3 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  29.17 
 
 		 510 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  30.82 
 
 		 583 aa  61.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  35.53 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  25.42 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  42.86 
 
 		 595 aa  57  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  28.57 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  28.7 
 
 		 227 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  21.67 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  28.06 
 
 		 688 aa  53.5  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.77 
 
 		 548 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  27.27 
 
 		 666 aa  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  22.3 
 
 		 442 aa  48.9  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  20.82 
 
 		 584 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  34.29 
 
 		 572 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  47.06 
 
 		 496 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  27.52 
 
 		 597 aa  47.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  28.97 
 
 		 586 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  22.48 
 
 		 346 aa  46.6  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  36.84 
 
 		 680 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  37.5 
 
 		 457 aa  45.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0135  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.203  normal  0.0435696 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  27.84 
 
 		 513 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1441  hypothetical protein  28.38 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0532167  hitchhiker  0.00000885873 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  34.09 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.23 
 
 		 669 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3178  putative ATP binding protein  29.41 
 
 		 496 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.033124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.25 
 
 		 677 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  23.47 
 
 		 451 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.25 
 
 		 677 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2294  hypothetical protein  33.33 
 
 		 549 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  30.38 
 
 		 566 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  41.38 
 
 		 615 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  30.67 
 
 		 486 aa  44.3  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1005  hypothetical protein  23.16 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.729513  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  36.36 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  26 
 
 		 418 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  29.76 
 
 		 416 aa  43.5  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  26.26 
 
 		 642 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  39.29 
 
 		 616 aa  43.1  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1481  hypothetical protein  31.68 
 
 		 140 aa  43.1  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 349 aa  43.1  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  34.18 
 
 		 355 aa  43.1  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  34.18 
 
 		 457 aa  42.7  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>