90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1691 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  100 
 
 
378 aa  776    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  38.1 
 
 
457 aa  147  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  25.11 
 
 
465 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  25.83 
 
 
466 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  28.01 
 
 
459 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  25.9 
 
 
368 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  28.72 
 
 
459 aa  116  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  25.28 
 
 
464 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  25.73 
 
 
378 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  25.06 
 
 
429 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  28.97 
 
 
363 aa  106  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  26.49 
 
 
374 aa  106  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  26.62 
 
 
378 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  23.11 
 
 
408 aa  103  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  26.33 
 
 
371 aa  98.6  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  28.46 
 
 
374 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  25.63 
 
 
391 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  27.34 
 
 
369 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  32.63 
 
 
478 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  25.59 
 
 
428 aa  97.1  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  40.8 
 
 
527 aa  95.1  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  31.28 
 
 
508 aa  92.8  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  26.63 
 
 
451 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  30.43 
 
 
465 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  35.5 
 
 
224 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  29.89 
 
 
483 aa  83.6  0.000000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  32.96 
 
 
565 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  32.07 
 
 
435 aa  80.5  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  32.62 
 
 
514 aa  79.7  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  31.25 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  31.34 
 
 
467 aa  74.3  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  25.27 
 
 
510 aa  72.8  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  31.02 
 
 
617 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  31.82 
 
 
595 aa  70.5  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  27.27 
 
 
555 aa  70.1  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  27.23 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  20.41 
 
 
399 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1441  hypothetical protein  22.6 
 
 
307 aa  60.1  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0532167  hitchhiker  0.00000885873 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  26.62 
 
 
461 aa  56.2  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0135  hypothetical protein  38.67 
 
 
96 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.203  normal  0.0435696 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  22.19 
 
 
382 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  38.3 
 
 
339 aa  52.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  32.26 
 
 
566 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  21.56 
 
 
571 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1988  hypothetical protein  36.84 
 
 
347 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  21.26 
 
 
424 aa  50.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  48.21 
 
 
454 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0943  hypothetical protein  31.09 
 
 
565 aa  50.4  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000190881  hitchhiker  0.00360431 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  22.28 
 
 
411 aa  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  21.07 
 
 
422 aa  50.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  34.78 
 
 
437 aa  49.7  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.91 
 
 
548 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  20.11 
 
 
584 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  26.47 
 
 
572 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1095  hypothetical protein  28 
 
 
453 aa  47  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00653553  hitchhiker  0.00178411 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  25.61 
 
 
442 aa  47  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  24.03 
 
 
513 aa  46.2  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  31.91 
 
 
454 aa  46.2  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  38.89 
 
 
540 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  26.61 
 
 
460 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  37.5 
 
 
387 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  21.67 
 
 
423 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4266  ATPase-like protein  32.97 
 
 
361 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5454  ATP-binding protein  22.8 
 
 
356 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.696652  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  20.34 
 
 
380 aa  44.3  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  31.51 
 
 
572 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  30.77 
 
 
460 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  37.5 
 
 
685 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  30.77 
 
 
460 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  20.7 
 
 
362 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  20.56 
 
 
390 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0895  hypothetical protein  29.07 
 
 
347 aa  44.3  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.295883  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  40 
 
 
394 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  30.21 
 
 
558 aa  44.3  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  36.25 
 
 
1218 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  21.05 
 
 
346 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  36.17 
 
 
1188 aa  43.9  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  36.25 
 
 
1188 aa  43.9  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  29.33 
 
 
457 aa  43.5  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  45.24 
 
 
381 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  21.79 
 
 
349 aa  43.5  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  42 
 
 
392 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  19.42 
 
 
580 aa  43.5  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  35.59 
 
 
419 aa  43.1  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  42.5 
 
 
392 aa  43.1  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.47 
 
 
415 aa  43.1  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  21.49 
 
 
390 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  38.1 
 
 
648 aa  42.7  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  21.04 
 
 
390 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  42.31 
 
 
377 aa  42.7  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.329241 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>