100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0640 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  919    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  45.53 
 
 		 457 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0789  hypothetical protein  40.56 
 
 		 396 aa  253  7e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3383  hypothetical protein  35.33 
 
 		 456 aa  91.3  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  24.69 
 
 		 513 aa  84.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  33.62 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  50 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  33.62 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  50 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  31.29 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  40.91 
 
 		 451 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1940  hypothetical protein  24.23 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.34914  hitchhiker  0.0000000111377 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1538  hypothetical protein  31.93 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  40.62 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  39.77 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  31.85 
 
 		 224 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  43.55 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1118  hypothetical protein  25.48 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.146528  hitchhiker  0.0000000167216 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0989  hypothetical protein  35.88 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.613523  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  29.5 
 
 		 369 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1005  hypothetical protein  23.3 
 
 		 429 aa  57  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.729513  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  26.62 
 
 		 378 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  26.67 
 
 		 527 aa  56.2  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2348  hypothetical protein  25.64 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  23.75 
 
 		 451 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  38.36 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  31.37 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  24.1 
 
 		 617 aa  54.3  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  28.02 
 
 		 464 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1205  ABC transporter related protein  29.57 
 
 		 251 aa  53.9  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00143482  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  30.43 
 
 		 227 aa  53.9  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  34.09 
 
 		 435 aa  53.5  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  28.41 
 
 		 510 aa  53.5  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  26.02 
 
 		 466 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  27.87 
 
 		 377 aa  53.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  37.1 
 
 		 363 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  32.62 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3360  hypothetical protein  37.08 
 
 		 437 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  33.33 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  23.97 
 
 		 483 aa  51.6  0.00003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  34.48 
 
 		 467 aa  51.6  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  33.33 
 
 		 584 aa  50.4  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  38.24 
 
 		 391 aa  49.7  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  28.67 
 
 		 465 aa  49.3  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  29.49 
 
 		 457 aa  49.3  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  40.35 
 
 		 793 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  39.19 
 
 		 368 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  44.62 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0471  hypothetical protein  34.48 
 
 		 533 aa  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0692558  decreased coverage  0.00000000612882 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00630  hypothetical protein  31.4 
 
 		 535 aa  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0944683  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  26.62 
 
 		 465 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0943  hypothetical protein  29.79 
 
 		 565 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000190881  hitchhiker  0.00360431 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  31.71 
 
 		 388 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  33.33 
 
 		 386 aa  47.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  31.36 
 
 		 377 aa  47.4  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2713  hypothetical protein  24.84 
 
 		 401 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  35.16 
 
 		 388 aa  47  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1517  hypothetical protein  35.05 
 
 		 556 aa  47  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.019243  normal  0.812738 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  40.51 
 
 		 642 aa  47  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1861  hypothetical protein  40.35 
 
 		 332 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.61669 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  37.08 
 
 		 773 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  31.46 
 
 		 572 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3161  Type I secretion system ATPase, PrtD  31.62 
 
 		 598 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  31.18 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  32.47 
 
 		 564 aa  45.8  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  36.99 
 
 		 368 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  41.54 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  41.89 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  32.67 
 
 		 253 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  40 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  36.92 
 
 		 312 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  44.07 
 
 		 782 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.66 
 
 		 321 aa  44.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  25.14 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  34.88 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  31.03 
 
 		 514 aa  44.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1487  hypothetical protein  54.76 
 
 		 343 aa  44.3  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.10218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  36.36 
 
 		 408 aa  44.3  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  36.47 
 
 		 387 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  32.08 
 
 		 314 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  44.3  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  36.11 
 
 		 304 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1518  ABC transporter related  25.37 
 
 		 253 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  28.57 
 
 		 442 aa  44.3  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  26.67 
 
 		 666 aa  44.3  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  43.48 
 
 		 496 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  32.76 
 
 		 780 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  37.88 
 
 		 388 aa  43.9  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  37.31 
 
 		 390 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2233  hypothetical protein  31.76 
 
 		 339 aa  43.9  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1408  ABC transporter related  33.64 
 
 		 303 aa  43.9  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.021534 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  27.19 
 
 		 497 aa  43.9  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05156  heme acquisition ABC transporter HasD  33.73 
 
 		 576 aa  43.5  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0568  ABC transporter related  31.31 
 
 		 241 aa  43.5  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  34.88 
 
 		 390 aa  43.9  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  30.53 
 
 		 390 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  30.53 
 
 		 390 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0860  ABC transporter related  29.25 
 
 		 249 aa  43.1  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000637207  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  36.92 
 
 		 399 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  27.27 
 
 		 406 aa  43.1  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>