111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2912 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  100 
 
 		 418 aa  860    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  51.64 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  47.51 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  44.73 
 
 		 419 aa  338  8e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4235  ATPase-like protein  57.56 
 
 		 187 aa  208  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  28.04 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  27.64 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  27.63 
 
 		 397 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  28.4 
 
 		 380 aa  90.9  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  22.46 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  24.87 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  26.33 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  23.56 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  23.21 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  23.79 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  23.79 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  23.77 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  21.93 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  23.91 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  23.67 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  22.46 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  33.62 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  23.1 
 
 		 486 aa  60.1  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  29.58 
 
 		 336 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  25.06 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2290  hypothetical protein  27.04 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  22.98 
 
 		 373 aa  57  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  21.96 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  23.04 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  37.17 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  25.13 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  22.42 
 
 		 369 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  36.59 
 
 		 226 aa  53.5  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  22.66 
 
 		 448 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2858  hypothetical protein  24.19 
 
 		 371 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3238  hypothetical protein  24.19 
 
 		 371 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.361757 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2778  hypothetical protein  28 
 
 		 490 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000124034  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  22.44 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  21.73 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  21.97 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  29.6 
 
 		 359 aa  50.1  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8073  ATPase-like protein  27.98 
 
 		 362 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  36.49 
 
 		 370 aa  49.7  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  36.49 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  22.56 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  27.97 
 
 		 368 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  42.59 
 
 		 368 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1106  hypothetical protein  52.38 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0316487  hitchhiker  0.000249477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  33.63 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  35.96 
 
 		 394 aa  47.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  22.65 
 
 		 364 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  26.87 
 
 		 357 aa  47.4  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  37.25 
 
 		 370 aa  47  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  37.25 
 
 		 370 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  26.77 
 
 		 423 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  31.19 
 
 		 378 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1920  abortive phage resistance protein-like  22.98 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000340563  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1945  hypothetical protein  50 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.710745  hitchhiker  0.000000000000362051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  29.25 
 
 		 410 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  29.47 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  27.97 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  22.2 
 
 		 659 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  27.97 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0405  FeS assembly ATPase SufC  32.43 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.300963  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  36.49 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3791  abortive phage resistance protein-like  22.76 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.618475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  31.96 
 
 		 370 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  32 
 
 		 424 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4110  ATPase-like protein  22.32 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000135453 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  37.14 
 
 		 1194 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2026  hypothetical protein  23.99 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  31.47 
 
 		 1167 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  46.34 
 
 		 464 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1890  hypothetical protein  35.29 
 
 		 389 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0931  hypothetical protein  27.66 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  21.82 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  21.78 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  26 
 
 		 263 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  20.63 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  29.45 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1217 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  26 
 
 		 408 aa  43.9  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2281  FeS assembly ATPase SufC  31.53 
 
 		 262 aa  44.3  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  19.85 
 
 		 376 aa  43.9  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2264  hypothetical protein  32.69 
 
 		 385 aa  43.9  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.000000152095  unclonable  0.0000000148287 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  45.45 
 
 		 374 aa  44.3  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  32.88 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  25 
 
 		 367 aa  43.9  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  38.57 
 
 		 1234 aa  43.9  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  38.57 
 
 		 1224 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  36.71 
 
 		 394 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3860  ATPase-like  43.75 
 
 		 370 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.247695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  35.71 
 
 		 1222 aa  43.5  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  35.38 
 
 		 527 aa  43.5  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  38.57 
 
 		 1181 aa  43.5  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  32.95 
 
 		 1019 aa  43.5  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  30.23 
 
 		 416 aa  43.5  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0121  ATPase-like protein  34.43 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188452 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  30.28 
 
 		 1191 aa  43.5  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  35.87 
 
 		 1140 aa  43.5  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>