170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1846 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  100 
 
 
409 aa  838    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  29.47 
 
 
397 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  28.47 
 
 
380 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  25.75 
 
 
412 aa  109  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  27.95 
 
 
378 aa  102  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  24.16 
 
 
370 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  24.68 
 
 
370 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  27.79 
 
 
411 aa  97.4  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  26.09 
 
 
394 aa  95.5  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  32.93 
 
 
367 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  32.93 
 
 
367 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  22.79 
 
 
370 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  22.5 
 
 
377 aa  87  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  26.8 
 
 
424 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  24.59 
 
 
448 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  24.59 
 
 
448 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  24.8 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  24.23 
 
 
369 aa  83.6  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  25 
 
 
430 aa  82.8  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  24.94 
 
 
399 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  28.76 
 
 
384 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  22.28 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  28.99 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  28.74 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  23.83 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  27.27 
 
 
368 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  24.37 
 
 
364 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  21.79 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  24.19 
 
 
386 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  24.05 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  23.31 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  21.55 
 
 
395 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  25 
 
 
369 aa  77  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  22.59 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  22.59 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  24.7 
 
 
417 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  23.26 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  22.92 
 
 
365 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  24.13 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  25.74 
 
 
363 aa  73.6  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  33.56 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  22.7 
 
 
365 aa  73.2  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  25.07 
 
 
394 aa  72.8  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  31.41 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  29.14 
 
 
384 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  21.57 
 
 
362 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  23.71 
 
 
397 aa  72  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  24.75 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  25.85 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  28.82 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  29.73 
 
 
382 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  29.55 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  23.21 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  23.43 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  30.17 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  29.46 
 
 
427 aa  66.6  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  24.55 
 
 
398 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4080  hypothetical protein  23.95 
 
 
397 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  24.6 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  26.35 
 
 
394 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  28.5 
 
 
405 aa  64.3  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  26.04 
 
 
390 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  21.02 
 
 
388 aa  63.9  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  26.85 
 
 
369 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  25.13 
 
 
390 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0931  hypothetical protein  24.86 
 
 
385 aa  63.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  24.53 
 
 
390 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  39.33 
 
 
395 aa  63.2  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  24.53 
 
 
390 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4110  ATPase-like protein  23.92 
 
 
427 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000135453 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  35.35 
 
 
357 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  36.9 
 
 
385 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  41.03 
 
 
386 aa  62  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  25.63 
 
 
388 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  23.53 
 
 
367 aa  62  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1458  hypothetical protein  34.23 
 
 
431 aa  61.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  32.38 
 
 
399 aa  61.6  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  24.8 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  24.06 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  35.71 
 
 
409 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  38.1 
 
 
392 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  24.53 
 
 
390 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  23.02 
 
 
416 aa  60.1  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  44.44 
 
 
390 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  23.32 
 
 
390 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  44.44 
 
 
390 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  23.76 
 
 
436 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  23.76 
 
 
392 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  23.76 
 
 
436 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  23.76 
 
 
436 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  23.76 
 
 
392 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  23.76 
 
 
392 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  23.76 
 
 
436 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  30.48 
 
 
398 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  25.7 
 
 
393 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  24.86 
 
 
386 aa  57.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  33.98 
 
 
410 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  44.29 
 
 
388 aa  57  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  33.65 
 
 
387 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  33.65 
 
 
387 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>