18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2026 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2026  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  753    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3238  hypothetical protein  81.03 
 
 
371 aa  628  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.361757 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2858  hypothetical protein  81.03 
 
 
371 aa  628  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1883  hypothetical protein  72.21 
 
 
369 aa  570  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3860  ATPase-like  27.45 
 
 
370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.247695  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  26.7 
 
 
419 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  26 
 
 
363 aa  55.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  22.22 
 
 
378 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  25.31 
 
 
363 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  20.86 
 
 
362 aa  50.8  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  27.01 
 
 
419 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  24.58 
 
 
380 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  20.06 
 
 
370 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  23.99 
 
 
418 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  20.06 
 
 
370 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  23.29 
 
 
395 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  25.52 
 
 
405 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  20.66 
 
 
394 aa  43.5  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>