165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1754 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  827    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  61.68 
 
 		 399 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  58.21 
 
 		 411 aa  457  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  57.44 
 
 		 424 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  41.88 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  40.25 
 
 		 394 aa  316  5e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  42 
 
 		 397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  40.72 
 
 		 395 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  41.98 
 
 		 376 aa  289  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  40.66 
 
 		 399 aa  289  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  40.72 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  40.77 
 
 		 398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  38.64 
 
 		 394 aa  277  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  36.77 
 
 		 430 aa  265  8.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  39.56 
 
 		 416 aa  255  9e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  25.24 
 
 		 412 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  28.89 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  27.18 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  27.07 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  25.57 
 
 		 378 aa  94  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  27.02 
 
 		 368 aa  93.6  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  28.3 
 
 		 386 aa  93.6  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  24.75 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  24.75 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  26.55 
 
 		 378 aa  90.5  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  24.16 
 
 		 382 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  23.93 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  25.63 
 
 		 364 aa  88.2  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  24.36 
 
 		 364 aa  86.3  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  24.05 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  26.56 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  26.32 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  27.27 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  25.53 
 
 		 390 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  25.53 
 
 		 390 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  23.99 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  24.87 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  24.1 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  24.1 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  28.38 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  25.53 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  24.12 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  28.5 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  24.8 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  25.99 
 
 		 394 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  24.8 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  25.26 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  26.88 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  28.22 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0121  ATPase-like protein  23.94 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188452 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  26.48 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  22.87 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  25.83 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  27.22 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  25.54 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  25 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  25.78 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  22.87 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  25.38 
 
 		 448 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  23.91 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  26.43 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  27.57 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  26.16 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  27.72 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  26.16 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  26.37 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  27.79 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  26.38 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  26.43 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  25.45 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  25.47 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  26.03 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  23.8 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1106  hypothetical protein  25.9 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0316487  hitchhiker  0.000249477 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  22.12 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  25.89 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  24.87 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  45.61 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  28.05 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  26.33 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  26.67 
 
 		 390 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  25.89 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  26.33 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  25.9 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1945  hypothetical protein  24.4 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.710745  hitchhiker  0.000000000000362051 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1890  hypothetical protein  25.42 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  25 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  29.21 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  25.37 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  25.45 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  22.22 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  29.32 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  24.93 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  25.77 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  25 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  25.77 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  25.77 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  25 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  25.77 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  26.53 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>