24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1883 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1883  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  758    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3238  hypothetical protein  72.24 
 
 		 371 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.361757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2026  hypothetical protein  72.21 
 
 		 367 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2858  hypothetical protein  72.24 
 
 		 371 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3860  ATPase-like  26.61 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.247695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  23.21 
 
 		 380 aa  49.7  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  23.89 
 
 		 376 aa  49.7  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  20.45 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  22.4 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4080  hypothetical protein  20.51 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  19.94 
 
 		 363 aa  46.6  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  20.69 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  24.69 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  20.1 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  20.22 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  21.18 
 
 		 362 aa  44.3  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  29.35 
 
 		 252 aa  44.3  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  19.19 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  30.15 
 
 		 419 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  19.94 
 
 		 370 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  43.14 
 
 		 381 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  32.08 
 
 		 696 aa  42.7  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  29.17 
 
 		 242 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06651  mRNA-nucleus export ATPase (Elf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03580)  32.94 
 
 		 1118 aa  42.7  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>