21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3238 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3238  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  764    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.361757 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2858  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  764    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2026  hypothetical protein  81.03 
 
 
367 aa  628  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1883  hypothetical protein  72.24 
 
 
369 aa  570  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3860  ATPase-like  28.35 
 
 
370 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.247695  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  27.05 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  21.16 
 
 
378 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  24 
 
 
363 aa  53.9  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  24.19 
 
 
418 aa  53.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  24.79 
 
 
419 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  20.95 
 
 
362 aa  50.4  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  20.74 
 
 
370 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  24.93 
 
 
416 aa  50.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  23.49 
 
 
363 aa  50.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  20.11 
 
 
394 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  20.56 
 
 
370 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  46.94 
 
 
356 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  23.04 
 
 
362 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  21.17 
 
 
395 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  45.1 
 
 
381 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1487  hypothetical protein  38.96 
 
 
343 aa  43.5  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.10218  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>