145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2545 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  100 
 
 
419 aa  855    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  51.64 
 
 
418 aa  387  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  46.82 
 
 
417 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  46.24 
 
 
419 aa  374  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4235  ATPase-like protein  58.05 
 
 
187 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  29.16 
 
 
450 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  27.21 
 
 
454 aa  123  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  27.49 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  26.72 
 
 
380 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  25.67 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  25.58 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  26.98 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  28.3 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  23.98 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  34.09 
 
 
368 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  24.53 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  26.7 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  25 
 
 
412 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  27.08 
 
 
378 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  23.34 
 
 
390 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  23.34 
 
 
390 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  24.41 
 
 
395 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  22.32 
 
 
384 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  23.01 
 
 
464 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  23.98 
 
 
370 aa  59.7  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  23.98 
 
 
388 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  24.68 
 
 
387 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  23.34 
 
 
390 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  25.13 
 
 
387 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  24.87 
 
 
387 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  35.16 
 
 
394 aa  58.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  31.13 
 
 
423 aa  57.4  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  29.41 
 
 
362 aa  57  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  22.04 
 
 
359 aa  57  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  23.83 
 
 
382 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  34.52 
 
 
409 aa  56.2  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  23.83 
 
 
382 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  21.67 
 
 
408 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8073  ATPase-like protein  29.01 
 
 
362 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  28 
 
 
448 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  28 
 
 
448 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  33.61 
 
 
367 aa  54.7  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  28.42 
 
 
357 aa  54.3  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  29.44 
 
 
399 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  33.08 
 
 
373 aa  53.9  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  29.93 
 
 
367 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  29.93 
 
 
367 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  23.18 
 
 
388 aa  53.1  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  30.5 
 
 
364 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3238  hypothetical protein  24.79 
 
 
371 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.361757 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2858  hypothetical protein  24.79 
 
 
371 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  29.55 
 
 
370 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4080  hypothetical protein  25.43 
 
 
397 aa  51.6  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  29.55 
 
 
370 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  30.88 
 
 
364 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  22.79 
 
 
429 aa  50.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  28.71 
 
 
384 aa  50.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  34.25 
 
 
226 aa  50.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1890  hypothetical protein  24.8 
 
 
389 aa  50.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  24.76 
 
 
459 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  30.34 
 
 
369 aa  49.7  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2264  hypothetical protein  34.29 
 
 
385 aa  49.7  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.000000152095  unclonable  0.0000000148287 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  29.63 
 
 
365 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  22.64 
 
 
399 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  33.06 
 
 
411 aa  49.7  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  31.4 
 
 
363 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  26.2 
 
 
555 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  25.67 
 
 
555 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  31.54 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  30.36 
 
 
382 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  32.22 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  30.1 
 
 
385 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  42.59 
 
 
409 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  23.62 
 
 
381 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  24.93 
 
 
422 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  26.49 
 
 
370 aa  47.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  43.33 
 
 
393 aa  47.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2778  hypothetical protein  36.36 
 
 
490 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000124034  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  26.88 
 
 
385 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1945  hypothetical protein  42.86 
 
 
374 aa  47  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.710745  hitchhiker  0.000000000000362051 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.36 
 
 
616 aa  47  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  43.33 
 
 
410 aa  47  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  21.39 
 
 
378 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  31.82 
 
 
427 aa  47  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  30.73 
 
 
405 aa  47  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  41.82 
 
 
390 aa  46.6  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2132  abortive infection protein, putative  21.59 
 
 
432 aa  46.6  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.903649  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  30.58 
 
 
363 aa  46.6  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  30.43 
 
 
365 aa  46.6  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  22.3 
 
 
369 aa  46.6  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  43.64 
 
 
390 aa  46.6  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  36.36 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  29.11 
 
 
486 aa  46.2  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0931  hypothetical protein  23.42 
 
 
385 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  37.97 
 
 
393 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  24.45 
 
 
438 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  43.64 
 
 
395 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  31.25 
 
 
378 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  45.83 
 
 
374 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  29.79 
 
 
416 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.960092 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>