172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1302 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  100 
 
 
419 aa  855    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  47.26 
 
 
417 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  46.24 
 
 
419 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  44.73 
 
 
418 aa  338  8e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4235  ATPase-like protein  65.32 
 
 
187 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  32.46 
 
 
450 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  28.7 
 
 
454 aa  129  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  29.43 
 
 
380 aa  87  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  25.12 
 
 
448 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  24.88 
 
 
448 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  25.45 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  26.97 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  26.17 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  23.17 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2858  hypothetical protein  27.05 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  26.54 
 
 
422 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3238  hypothetical protein  27.05 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.361757 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  23.98 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  25.2 
 
 
395 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  30.57 
 
 
226 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  23.91 
 
 
416 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  25.65 
 
 
378 aa  64.3  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  23.3 
 
 
384 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  25.91 
 
 
369 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  24.74 
 
 
386 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 
378 aa  60.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  23.93 
 
 
370 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  29.82 
 
 
423 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  28 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  35.42 
 
 
368 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  23.32 
 
 
370 aa  57  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  22.94 
 
 
409 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2026  hypothetical protein  26.7 
 
 
367 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  28.97 
 
 
409 aa  56.2  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  24.3 
 
 
364 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  25 
 
 
362 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  22.82 
 
 
370 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  23.35 
 
 
398 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  23.35 
 
 
369 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  38.84 
 
 
394 aa  53.9  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  24.53 
 
 
365 aa  53.9  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2290  hypothetical protein  24.33 
 
 
409 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18336  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  22.57 
 
 
378 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  34.09 
 
 
377 aa  53.9  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  31.71 
 
 
411 aa  53.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8073  ATPase-like protein  26.83 
 
 
362 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1890  hypothetical protein  39.71 
 
 
389 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4110  ATPase-like protein  24.41 
 
 
427 aa  51.2  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000135453 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  31.97 
 
 
399 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1106  hypothetical protein  37.5 
 
 
372 aa  50.4  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0316487  hitchhiker  0.000249477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0121  ATPase-like protein  22.17 
 
 
407 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0931  hypothetical protein  26.03 
 
 
385 aa  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  32.99 
 
 
410 aa  50.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  24.11 
 
 
394 aa  49.7  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  21.51 
 
 
367 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1945  hypothetical protein  38.84 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.710745  hitchhiker  0.000000000000362051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  47.83 
 
 
368 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  21.51 
 
 
367 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  22.91 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  31.25 
 
 
405 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  22.04 
 
 
399 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  45.28 
 
 
374 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  33 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  34.67 
 
 
385 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  29.03 
 
 
364 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  41.18 
 
 
393 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  23.28 
 
 
365 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  26.09 
 
 
427 aa  47.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  23.24 
 
 
390 aa  47.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  22.41 
 
 
417 aa  47.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  36.46 
 
 
1234 aa  47.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  24.4 
 
 
385 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  21.9 
 
 
378 aa  47.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  25.67 
 
 
385 aa  47.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  23.25 
 
 
451 aa  47  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  37.5 
 
 
1194 aa  47  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  34.67 
 
 
390 aa  47  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  26.49 
 
 
370 aa  47  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  56.82 
 
 
1198 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  33.33 
 
 
390 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  33.33 
 
 
390 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  35.29 
 
 
395 aa  47  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  33.33 
 
 
390 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  24.26 
 
 
438 aa  46.6  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  36.46 
 
 
1227 aa  46.6  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  37.5 
 
 
1194 aa  46.6  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  24.62 
 
 
433 aa  46.2  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  25.49 
 
 
362 aa  46.6  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  43.14 
 
 
1146 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  37.5 
 
 
1199 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  37.5 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  20.36 
 
 
584 aa  46.2  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  37.5 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2264  hypothetical protein  30.91 
 
 
385 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.000000152095  unclonable  0.0000000148287 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  34.85 
 
 
341 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  51.11 
 
 
1179 aa  46.2  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  36.49 
 
 
388 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  40.98 
 
 
385 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  36.46 
 
 
1217 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  33.33 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>