148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3499 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  100 
 
 		 363 aa  753    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  96.14 
 
 		 363 aa  726    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  66.85 
 
 		 365 aa  522  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  55.01 
 
 		 416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  51.37 
 
 		 373 aa  386  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  53.04 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  46.24 
 
 		 370 aa  349  5e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  46.24 
 
 		 370 aa  348  6e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  48.91 
 
 		 370 aa  346  4e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  47.09 
 
 		 357 aa  338  5.9999999999999996e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  46.94 
 
 		 364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  44.54 
 
 		 369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  46.03 
 
 		 362 aa  309  4e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  44.8 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  44.99 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  42.82 
 
 		 367 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  42.82 
 
 		 367 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  42.2 
 
 		 377 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  42.08 
 
 		 368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  39.36 
 
 		 378 aa  268  8e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  38.11 
 
 		 369 aa  263  3e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  38.11 
 
 		 384 aa  236  3e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  39.73 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  34.68 
 
 		 376 aa  203  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  31.22 
 
 		 395 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  26.75 
 
 		 382 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  25.71 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  25.71 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  29.18 
 
 		 386 aa  125  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  28.91 
 
 		 397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  26.52 
 
 		 397 aa  109  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  37.23 
 
 		 398 aa  102  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  26.25 
 
 		 390 aa  99.8  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  25 
 
 		 385 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  34.84 
 
 		 394 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  25.59 
 
 		 390 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  26.04 
 
 		 390 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  25.78 
 
 		 390 aa  96.7  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  26.72 
 
 		 369 aa  96.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  25.38 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  25.58 
 
 		 395 aa  95.5  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  26.6 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  26.7 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  25.13 
 
 		 390 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  24.87 
 
 		 390 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  25.86 
 
 		 409 aa  92.8  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  25.13 
 
 		 390 aa  92.8  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  26.17 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  26.02 
 
 		 412 aa  91.3  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  30.62 
 
 		 226 aa  89.7  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  25.31 
 
 		 392 aa  87.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  23.99 
 
 		 390 aa  87  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  22.4 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  24.34 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  24.35 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  24.01 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  23.43 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  23.43 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  24.67 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  24.65 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  24.1 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  24.07 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  23.18 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  25.94 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  26.52 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  24.19 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  25.69 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  25.12 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  25.69 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  23.37 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  25.69 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  25.69 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  25.69 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  25.69 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  24.2 
 
 		 367 aa  75.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  23.1 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  22.93 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  25.74 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  24.15 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  23.43 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  25.63 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  23.6 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  23.25 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  25 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  26.58 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  23.55 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  40 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  22.02 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  23.63 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  25.54 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  26.36 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  38.54 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  26.85 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  23.96 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  23.91 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  27.09 
 
 		 450 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  25.95 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  23.38 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  22.83 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  36.45 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>