142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0843 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  79.34 
 
 
390 aa  646    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  78.72 
 
 
390 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  78.46 
 
 
390 aa  636    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  78.46 
 
 
390 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  82.44 
 
 
395 aa  686    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  78.57 
 
 
390 aa  638    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  89.82 
 
 
410 aa  732    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  806    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  77.81 
 
 
390 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  77.81 
 
 
390 aa  631  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  77.55 
 
 
390 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  64.52 
 
 
386 aa  522  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  64.27 
 
 
386 aa  502  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  60.61 
 
 
388 aa  485  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  59.74 
 
 
387 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  59.49 
 
 
387 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  58.46 
 
 
387 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  57.91 
 
 
392 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  56.39 
 
 
395 aa  441  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  57.14 
 
 
387 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  53.42 
 
 
393 aa  438  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  57.14 
 
 
387 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  58.02 
 
 
386 aa  435  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  54.43 
 
 
390 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  56.63 
 
 
436 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  56.63 
 
 
392 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  56.63 
 
 
436 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  56.63 
 
 
436 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  56.89 
 
 
392 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  56.63 
 
 
392 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  56.63 
 
 
436 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  55.1 
 
 
388 aa  418  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  57.14 
 
 
392 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  54.91 
 
 
393 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  57.14 
 
 
391 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  57.14 
 
 
391 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  57.14 
 
 
391 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  52.3 
 
 
385 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  53.57 
 
 
385 aa  385  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  57.14 
 
 
391 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  56.89 
 
 
391 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  56.63 
 
 
391 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  49.75 
 
 
390 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  51.5 
 
 
393 aa  378  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  51.65 
 
 
388 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  47.74 
 
 
390 aa  349  6e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  47.74 
 
 
390 aa  349  6e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  46.98 
 
 
388 aa  343  4e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  47.74 
 
 
390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  47.36 
 
 
388 aa  324  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  46.5 
 
 
392 aa  310  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  41.32 
 
 
365 aa  288  9e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  40.94 
 
 
362 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  41.01 
 
 
367 aa  278  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  40.74 
 
 
361 aa  245  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  36.2 
 
 
384 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  35.32 
 
 
385 aa  200  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  36 
 
 
410 aa  197  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  38.97 
 
 
385 aa  194  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  34.45 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  26.9 
 
 
382 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  26.9 
 
 
382 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  25.19 
 
 
378 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  24.49 
 
 
382 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  28.15 
 
 
395 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  26.09 
 
 
386 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  25.54 
 
 
368 aa  93.2  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  26.17 
 
 
363 aa  92.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  23.06 
 
 
377 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  26.7 
 
 
363 aa  90.5  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  22.59 
 
 
365 aa  90.5  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  24.16 
 
 
370 aa  89.4  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  27.25 
 
 
409 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  27.25 
 
 
397 aa  87.8  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  27.35 
 
 
398 aa  88.2  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  25.18 
 
 
378 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  24.38 
 
 
369 aa  87  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  24.12 
 
 
367 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  24.12 
 
 
367 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  23.98 
 
 
416 aa  85.1  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  24.09 
 
 
395 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  28.31 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  26.68 
 
 
411 aa  84  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  24.56 
 
 
370 aa  83.6  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  25.2 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  24.56 
 
 
370 aa  82.8  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  24.81 
 
 
364 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  24.09 
 
 
395 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  26.68 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  23.14 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  24 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  22.22 
 
 
362 aa  75.9  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1049  hypothetical protein  61.4 
 
 
84 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  23.16 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  21.41 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  25.14 
 
 
399 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  26.45 
 
 
380 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  23.54 
 
 
416 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  25.13 
 
 
398 aa  71.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  25.68 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>