142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2311 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  100 
 
 		 397 aa  810    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  46.11 
 
 		 380 aa  318  9e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  29.47 
 
 		 409 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  26.58 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  26.52 
 
 		 363 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  26.41 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  25.87 
 
 		 378 aa  106  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  25 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  26.24 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  27.63 
 
 		 418 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  25.41 
 
 		 364 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  24.41 
 
 		 416 aa  97.4  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  27.3 
 
 		 411 aa  97.8  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  24.78 
 
 		 367 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  28.02 
 
 		 417 aa  96.3  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  24.78 
 
 		 367 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  26.5 
 
 		 399 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  27.68 
 
 		 424 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  26.85 
 
 		 398 aa  91.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  24.35 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  25.65 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  22.45 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  24.35 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  26.94 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  24.88 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  26.7 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  23.59 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  24.1 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  24.36 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  24.36 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  29.59 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  24.29 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  22.34 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  25.58 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  19.29 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  26.47 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  25.67 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1890  hypothetical protein  25 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  26.09 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  23.08 
 
 		 382 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  23.08 
 
 		 382 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8073  ATPase-like protein  29.31 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  26.23 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  27.23 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  26.32 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  23.38 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  28.4 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  26.17 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  25.97 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  24.16 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  22.19 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0931  hypothetical protein  26.03 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4080  hypothetical protein  24.93 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  25.65 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  23.46 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  25.38 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  28.69 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  26.29 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  25.56 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  24.1 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  25.55 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  22.91 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  26.32 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  23.31 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  24.02 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  37.5 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  26.43 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  28.95 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  26.15 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  25.72 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  26.26 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  25.94 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  24.34 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  32 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  23.82 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  42.19 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  26.69 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  25.63 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  25.9 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  24.49 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  24.34 
 
 		 450 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  26.75 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  23.85 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  24.31 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1458  hypothetical protein  20.76 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2290  hypothetical protein  23.1 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  25.38 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  27.17 
 
 		 386 aa  53.9  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  27.08 
 
 		 397 aa  53.5  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  27.22 
 
 		 385 aa  53.5  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  27.91 
 
 		 395 aa  53.1  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  22 
 
 		 423 aa  53.1  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4235  ATPase-like protein  38.75 
 
 		 187 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  45.9 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  23.63 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  24.43 
 
 		 382 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  44.19 
 
 		 647 aa  50.8  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0121  ATPase-like protein  22.16 
 
 		 407 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  42.62 
 
 		 390 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>