131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5526 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  761    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  68.31 
 
 
385 aa  478  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  57.77 
 
 
385 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  50.69 
 
 
410 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  49.35 
 
 
382 aa  332  8e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  39.63 
 
 
390 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  39.63 
 
 
390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  39.63 
 
 
390 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  39.11 
 
 
390 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  38.7 
 
 
390 aa  228  9e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  40.67 
 
 
395 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  38.7 
 
 
390 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  39.84 
 
 
392 aa  226  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  37.27 
 
 
365 aa  226  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  38.7 
 
 
390 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  38.56 
 
 
390 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  33.06 
 
 
362 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  42.86 
 
 
361 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  37.97 
 
 
386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  39.06 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  39.63 
 
 
436 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  39.63 
 
 
392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  39.63 
 
 
436 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  39.63 
 
 
436 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  39.63 
 
 
392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  39.63 
 
 
436 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  36.48 
 
 
410 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  39.63 
 
 
392 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  37.11 
 
 
395 aa  216  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  38.36 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  38.1 
 
 
385 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  40 
 
 
387 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  36.2 
 
 
393 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  40 
 
 
387 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  34.99 
 
 
388 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  39.23 
 
 
386 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  40 
 
 
392 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  37.7 
 
 
385 aa  202  8e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  38.29 
 
 
386 aa  202  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  36.46 
 
 
388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  35.58 
 
 
387 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  38.46 
 
 
388 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  35.32 
 
 
387 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  36.18 
 
 
387 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  40.62 
 
 
392 aa  193  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  39.52 
 
 
388 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  37.05 
 
 
393 aa  192  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  39.55 
 
 
390 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  38.66 
 
 
390 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  38.66 
 
 
390 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  40.26 
 
 
391 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  40 
 
 
391 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  38.68 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  39.74 
 
 
391 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  39.74 
 
 
391 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  39.47 
 
 
393 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  39.74 
 
 
391 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  36.05 
 
 
367 aa  181  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  38.66 
 
 
390 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  38.3 
 
 
388 aa  172  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  25.85 
 
 
382 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  25.85 
 
 
382 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  26.56 
 
 
378 aa  97.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  23.06 
 
 
364 aa  94  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  24.1 
 
 
378 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  23.9 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  24.65 
 
 
362 aa  88.6  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  25.13 
 
 
368 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  26.18 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  28.76 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  25.69 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  23.2 
 
 
395 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  22.86 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  26.76 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  22.69 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  24.26 
 
 
378 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  25.49 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  26.12 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  26.99 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  26.96 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  23.76 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  23.12 
 
 
370 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  23.43 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  22.64 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  23.55 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  23.87 
 
 
370 aa  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  26.11 
 
 
364 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  21.2 
 
 
412 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  22.13 
 
 
365 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  22.22 
 
 
367 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  24.72 
 
 
398 aa  65.1  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  22.22 
 
 
367 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  23.06 
 
 
363 aa  64.3  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  23.21 
 
 
430 aa  63.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  27.37 
 
 
409 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  22.32 
 
 
419 aa  62.8  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  31.93 
 
 
226 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  23.3 
 
 
419 aa  62  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  26.15 
 
 
398 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  23.86 
 
 
399 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>