190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2033 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  100 
 
 
399 aa  824    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  66.16 
 
 
411 aa  564  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  65.05 
 
 
424 aa  556  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  61.68 
 
 
405 aa  481  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  45.15 
 
 
393 aa  346  4e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  42.75 
 
 
394 aa  345  6e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  41.06 
 
 
397 aa  312  6.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  38.46 
 
 
430 aa  302  6.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  42.63 
 
 
376 aa  302  7.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  40.31 
 
 
399 aa  296  5e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  38.87 
 
 
398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  38.58 
 
 
394 aa  281  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  38.56 
 
 
395 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  39.51 
 
 
416 aa  280  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  38.56 
 
 
395 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  27.54 
 
 
409 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  26.85 
 
 
382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  25.65 
 
 
412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  26.85 
 
 
382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  26.63 
 
 
382 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  26.23 
 
 
362 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  29.1 
 
 
380 aa  99.8  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  26.57 
 
 
395 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  26.11 
 
 
378 aa  97.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  26.5 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  25.78 
 
 
364 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  28.27 
 
 
386 aa  94  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  27.96 
 
 
448 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  23.24 
 
 
427 aa  90.9  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  25.82 
 
 
390 aa  89.7  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  25.89 
 
 
369 aa  89.7  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  28.49 
 
 
448 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  28.69 
 
 
365 aa  87  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  24.13 
 
 
378 aa  86.7  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  26.57 
 
 
394 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  22.08 
 
 
362 aa  85.1  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  25 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  28.19 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  24.11 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  25.21 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  24.94 
 
 
409 aa  82.8  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  22.9 
 
 
373 aa  82  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  23.58 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  26.92 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  26.65 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  26.34 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  22.92 
 
 
368 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  26.92 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  22.44 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  24.65 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  24.62 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  25 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  26.92 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  23.78 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  24.19 
 
 
369 aa  76.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  24.65 
 
 
387 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  24.17 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  23.71 
 
 
378 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  34.44 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  23.92 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  23.91 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  25.21 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  25.8 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  33.33 
 
 
385 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  24.16 
 
 
367 aa  72.4  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  25.8 
 
 
390 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  25.14 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  25.53 
 
 
390 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  32.58 
 
 
390 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  32.58 
 
 
390 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  25.8 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  25 
 
 
410 aa  72  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  24.31 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1106  hypothetical protein  24.4 
 
 
372 aa  70.1  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0316487  hitchhiker  0.000249477 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  22.76 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  25.21 
 
 
361 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  30.13 
 
 
388 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  43.7 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  33.09 
 
 
388 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  24.53 
 
 
416 aa  67  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1945  hypothetical protein  24.2 
 
 
374 aa  67  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.710745  hitchhiker  0.000000000000362051 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  22.87 
 
 
417 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  22.93 
 
 
393 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  20.41 
 
 
378 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1458  hypothetical protein  25.64 
 
 
431 aa  64.3  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  30.23 
 
 
388 aa  64.7  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  22.54 
 
 
370 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  39.51 
 
 
388 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  21.23 
 
 
365 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  32.58 
 
 
390 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  29.41 
 
 
387 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  22.89 
 
 
436 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  23.04 
 
 
450 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  23.16 
 
 
392 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  38.54 
 
 
226 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  32.35 
 
 
395 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  34.44 
 
 
387 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  22.89 
 
 
436 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  23.16 
 
 
392 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  22.89 
 
 
436 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>