21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1106 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1106  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  751    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0316487  hitchhiker  0.000249477 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1945  hypothetical protein  93.03 
 
 
374 aa  699    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.710745  hitchhiker  0.000000000000362051 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0344  hypothetical protein  45.31 
 
 
378 aa  312  4.999999999999999e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1471  ATPase-like protein  32.24 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  24.4 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  25.43 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  23.27 
 
 
424 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  23.78 
 
 
411 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  25.9 
 
 
405 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  23.52 
 
 
416 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1472  ATPase-like protein  24.4 
 
 
426 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0862565  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  24.13 
 
 
369 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  37.5 
 
 
419 aa  50.4  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  52.38 
 
 
418 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1005  hypothetical protein  24.86 
 
 
429 aa  47  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.729513  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  47.62 
 
 
454 aa  46.6  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  45.65 
 
 
419 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  23.99 
 
 
399 aa  43.5  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1988  hypothetical protein  43.9 
 
 
347 aa  43.5  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  46.15 
 
 
460 aa  43.1  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0003  DNA replication and repair protein RecF  42.86 
 
 
382 aa  43.1  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>