15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1945 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1945  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  756    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.710745  hitchhiker  0.000000000000362051 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1106  hypothetical protein  93.03 
 
 
372 aa  699    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0316487  hitchhiker  0.000249477 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0344  hypothetical protein  45.26 
 
 
378 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1471  ATPase-like protein  31.31 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  24.2 
 
 
399 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  26.76 
 
 
380 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  22.95 
 
 
411 aa  56.6  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1472  ATPase-like protein  22.82 
 
 
426 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0862565  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  22.93 
 
 
424 aa  53.5  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  24.4 
 
 
405 aa  53.1  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  38.84 
 
 
419 aa  49.3  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  42.86 
 
 
419 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  50 
 
 
418 aa  46.2  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  52.63 
 
 
454 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  52.38 
 
 
416 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.960092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>