247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5825 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  100 
 
 
369 aa  749    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  26.6 
 
 
336 aa  124  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  25.65 
 
 
362 aa  102  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  26.48 
 
 
395 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  25.88 
 
 
386 aa  99.4  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  25.45 
 
 
378 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  26.72 
 
 
363 aa  96.7  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8073  ATPase-like protein  28.91 
 
 
362 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  24.56 
 
 
364 aa  90.5  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  25.9 
 
 
365 aa  90.5  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  26.55 
 
 
369 aa  88.2  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  26.24 
 
 
370 aa  88.6  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  25.7 
 
 
363 aa  87.8  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  26.49 
 
 
378 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  23.99 
 
 
377 aa  87.4  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  26.09 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  25.13 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  24.56 
 
 
384 aa  79.3  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  23.54 
 
 
370 aa  79.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  24 
 
 
370 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  23.75 
 
 
370 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  24.68 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  24.19 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  24.05 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0121  ATPase-like protein  23.11 
 
 
407 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188452 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  23.69 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  26 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  31.88 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  23.25 
 
 
369 aa  72  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  26.2 
 
 
416 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  23.5 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  39.1 
 
 
394 aa  70.1  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  25.63 
 
 
368 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  36.84 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  23.8 
 
 
436 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  23.8 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  28.26 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  23.8 
 
 
436 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  23.8 
 
 
436 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  23.8 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  23.8 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  23.8 
 
 
436 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  25.55 
 
 
376 aa  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0344  hypothetical protein  23.77 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  26.85 
 
 
409 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  23.23 
 
 
405 aa  63.5  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  28.57 
 
 
423 aa  63.2  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  24.32 
 
 
584 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  33.86 
 
 
411 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  25.91 
 
 
419 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  21.93 
 
 
418 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  33.7 
 
 
395 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  25.82 
 
 
430 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  41.67 
 
 
390 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  26.19 
 
 
367 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  26.19 
 
 
367 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1458  hypothetical protein  41.57 
 
 
431 aa  60.5  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  24.7 
 
 
382 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  24.7 
 
 
382 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  27.38 
 
 
386 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  22.01 
 
 
394 aa  60.1  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4110  ATPase-like protein  28.25 
 
 
427 aa  59.7  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000135453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  24.78 
 
 
416 aa  59.7  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  23.82 
 
 
397 aa  59.3  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  34.09 
 
 
424 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  26.09 
 
 
394 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  39.19 
 
 
367 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  36.49 
 
 
390 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  31.91 
 
 
387 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0931  hypothetical protein  24.23 
 
 
385 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  33.68 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  36.49 
 
 
390 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  31.91 
 
 
387 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  23.58 
 
 
564 aa  57.4  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  35.37 
 
 
385 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  23.18 
 
 
579 aa  56.2  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  31.54 
 
 
393 aa  56.2  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  22.5 
 
 
388 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  21.02 
 
 
574 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  22 
 
 
427 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  21.45 
 
 
422 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  28.46 
 
 
376 aa  54.7  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  34.44 
 
 
393 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4235  ATPase-like protein  30 
 
 
187 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  34.62 
 
 
386 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  22.75 
 
 
394 aa  53.5  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  23.62 
 
 
565 aa  53.5  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  28.49 
 
 
412 aa  53.5  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  28.57 
 
 
442 aa  53.1  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  22.07 
 
 
399 aa  53.1  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  32.61 
 
 
388 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  27.21 
 
 
388 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  40.28 
 
 
392 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  21.56 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  36.49 
 
 
390 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  25.9 
 
 
495 aa  51.6  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1106  hypothetical protein  24.13 
 
 
372 aa  51.6  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0316487  hitchhiker  0.000249477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  38.33 
 
 
390 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  50 
 
 
571 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  33.33 
 
 
564 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>