171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0007 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  100 
 
 		 411 aa  840    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  69.97 
 
 		 424 aa  579  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  66.16 
 
 		 399 aa  564  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  58.21 
 
 		 405 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  40.2 
 
 		 394 aa  306  5.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  41.67 
 
 		 397 aa  303  5.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  41.07 
 
 		 393 aa  300  4e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  41.78 
 
 		 376 aa  279  6e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  39.64 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  37.91 
 
 		 430 aa  272  7e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  37.69 
 
 		 395 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  37.69 
 
 		 395 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  38.46 
 
 		 398 aa  263  4e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  37.06 
 
 		 394 aa  260  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  37.04 
 
 		 416 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  29.52 
 
 		 409 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  27.18 
 
 		 382 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  27.18 
 
 		 382 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  24.7 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  26.93 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  25.58 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  29.38 
 
 		 365 aa  99.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  27.3 
 
 		 397 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  27.79 
 
 		 409 aa  97.4  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  20.09 
 
 		 448 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  27.62 
 
 		 380 aa  93.6  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  24.93 
 
 		 369 aa  92  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  20.96 
 
 		 448 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  27.2 
 
 		 386 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  26.72 
 
 		 387 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  26.54 
 
 		 390 aa  90.1  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  26.72 
 
 		 387 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  26.9 
 
 		 392 aa  89.7  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  26.72 
 
 		 390 aa  89.7  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  25.92 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  26.72 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  28.23 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  26.57 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  25.13 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  28.27 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  23.41 
 
 		 362 aa  87  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  25.39 
 
 		 390 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  25.39 
 
 		 390 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  24.35 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  23.97 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  24.8 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  26.68 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  26.24 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  25.32 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  25.77 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  27.02 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  24.16 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  25.39 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  25.53 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  26 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  23.02 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  25.18 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  24.02 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  25 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  24.11 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  25.3 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  25.44 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  26.14 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  22.25 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  25.89 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  25.69 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  26.14 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  26.14 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  25.89 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  25.89 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  26.14 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  24.94 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  25.9 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  19.68 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  25.42 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  22.34 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  24.82 
 
 		 384 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  26.65 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  21.79 
 
 		 364 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  24.94 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  22.6 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  24.32 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  23.51 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  25.87 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1458  hypothetical protein  23.89 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  23.99 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  24.75 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  23.6 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  24.54 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  26.12 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  25.12 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  25.97 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  24.59 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  24.69 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  24.49 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  24.49 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  24.27 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  23.88 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  44.35 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>