170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4170 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  86.72 
 
 
398 aa  720    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  815    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  67.18 
 
 
394 aa  542  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  63.96 
 
 
395 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  63.71 
 
 
395 aa  532  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  62.81 
 
 
397 aa  502  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  59.03 
 
 
393 aa  485  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  63.13 
 
 
376 aa  475  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  56.85 
 
 
394 aa  462  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  41.9 
 
 
424 aa  301  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  40.31 
 
 
399 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  39.64 
 
 
411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  40.56 
 
 
405 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  37.26 
 
 
430 aa  252  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  37.99 
 
 
416 aa  216  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  25.47 
 
 
362 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  27.59 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  24.32 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  27.49 
 
 
390 aa  94.4  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  27.27 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  27.27 
 
 
390 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  26.5 
 
 
386 aa  91.3  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  27.65 
 
 
380 aa  90.5  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  24.46 
 
 
382 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  23.81 
 
 
382 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  23.81 
 
 
382 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  25.52 
 
 
390 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  25.52 
 
 
390 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  24.56 
 
 
376 aa  86.3  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  26.71 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  27.64 
 
 
395 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  25.82 
 
 
392 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  26.48 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  26.71 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  25.73 
 
 
395 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  27.67 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  26.54 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  26.7 
 
 
397 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  26.2 
 
 
386 aa  82  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  25.58 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  26.68 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  22.64 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  22.56 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  24.7 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  24.38 
 
 
370 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  24.38 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  24.38 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  26.34 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  27.25 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  25.78 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  23.42 
 
 
378 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  22.33 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  24.8 
 
 
367 aa  75.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  26.58 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  26.76 
 
 
384 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  23.75 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  24.28 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  25.68 
 
 
388 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  26.29 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  24.52 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  22.5 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  24.4 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  27.32 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  24.94 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  26.12 
 
 
392 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  24.94 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  24.94 
 
 
365 aa  72.8  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  25.19 
 
 
436 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  25.19 
 
 
436 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  25.19 
 
 
436 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  25.19 
 
 
436 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  24.88 
 
 
391 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  24.94 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  24.94 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  24.74 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  20.72 
 
 
448 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  26.95 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  24.09 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  25.45 
 
 
386 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  25.25 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  21.84 
 
 
378 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  24.74 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  24.16 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  24.22 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  23.92 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  20.83 
 
 
427 aa  68.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  20.54 
 
 
448 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  24.23 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  26.1 
 
 
410 aa  67  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  26.01 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  25 
 
 
416 aa  66.2  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4110  ATPase-like protein  25.58 
 
 
427 aa  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000135453 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0931  hypothetical protein  25.58 
 
 
385 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  23.63 
 
 
363 aa  65.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  22.39 
 
 
365 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  23.83 
 
 
373 aa  65.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  23.25 
 
 
363 aa  64.7  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  25.79 
 
 
450 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  23.91 
 
 
386 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  26.54 
 
 
382 aa  63.5  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>