163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1966 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  860    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  69.97 
 
 		 411 aa  579  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  65.05 
 
 		 399 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  57.44 
 
 		 405 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  43.51 
 
 		 394 aa  342  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  42.34 
 
 		 393 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  42.68 
 
 		 397 aa  312  6.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  41.9 
 
 		 399 aa  301  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  40.46 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  43.28 
 
 		 376 aa  295  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  40.51 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  40.26 
 
 		 395 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  41.75 
 
 		 398 aa  290  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  36.74 
 
 		 430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  36.9 
 
 		 416 aa  270  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  26.28 
 
 		 382 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  26.28 
 
 		 382 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  29.74 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  25.79 
 
 		 382 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  24.06 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  25.69 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  27.18 
 
 		 364 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  27.57 
 
 		 362 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  21.21 
 
 		 448 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  29.38 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  27.68 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  28.7 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  27.32 
 
 		 395 aa  88.2  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  26.65 
 
 		 386 aa  87.4  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  25.51 
 
 		 370 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  24.87 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  26.8 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  21.06 
 
 		 448 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  23.94 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  26.14 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  23.12 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  23.53 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  23.99 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  22.48 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  23.33 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  27.49 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  23.61 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  27.46 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  24.03 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  25.81 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  26.63 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  26.46 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  23.32 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  27.84 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  23.76 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  24.29 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  22.96 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  27.13 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  26.3 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  27.13 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  26.82 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  24.62 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  21.76 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  27.13 
 
 		 390 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  28.27 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  24.43 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  42.06 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  27.64 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  24.43 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  24.43 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  24.12 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  24.12 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  24.12 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  24.12 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  26.19 
 
 		 390 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  24.8 
 
 		 393 aa  67  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  24.51 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  21.55 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  21.55 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  41.1 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  24.64 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  23.96 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  24.94 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  27.37 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  25.81 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  25.95 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  24.14 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  30.14 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  24.42 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  23.61 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  23.87 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  31.92 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  24.02 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  29.48 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1458  hypothetical protein  23.46 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  32.84 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  25.14 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  31.6 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  24.13 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  24.81 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  23.34 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  23.34 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  23.78 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  33.63 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  33.63 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>