153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0805 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  89.95 
 
 		 390 aa  712    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  94.07 
 
 		 390 aa  743    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  99.23 
 
 		 390 aa  785    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  98.72 
 
 		 390 aa  781    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  793    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  90.21 
 
 		 390 aa  716    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  82.14 
 
 		 395 aa  654    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  91.24 
 
 		 390 aa  723    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  89.95 
 
 		 390 aa  715    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  78.46 
 
 		 393 aa  637    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  78.46 
 
 		 410 aa  632  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  65.63 
 
 		 386 aa  527  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  65.12 
 
 		 386 aa  499  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  61.24 
 
 		 388 aa  480  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  58.66 
 
 		 392 aa  455  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  59.79 
 
 		 387 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  59.54 
 
 		 387 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  59.23 
 
 		 387 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  60.05 
 
 		 387 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  58.97 
 
 		 387 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  58.38 
 
 		 395 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  55.22 
 
 		 393 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  59.17 
 
 		 392 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  58.91 
 
 		 436 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  58.91 
 
 		 392 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  55.73 
 
 		 390 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  58.91 
 
 		 436 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  58.91 
 
 		 436 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  58.91 
 
 		 392 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  58.91 
 
 		 436 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  59.95 
 
 		 386 aa  438  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  58.4 
 
 		 392 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  56.07 
 
 		 388 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  58.16 
 
 		 393 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  58.66 
 
 		 391 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  58.91 
 
 		 391 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  58.91 
 
 		 391 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  58.91 
 
 		 391 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  58.66 
 
 		 391 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  58.4 
 
 		 391 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  56.33 
 
 		 385 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  53.49 
 
 		 385 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  53.16 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  50.64 
 
 		 390 aa  381  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  53.85 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  49.49 
 
 		 390 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  49.49 
 
 		 390 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  49.62 
 
 		 388 aa  349  5e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  49.49 
 
 		 390 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  49.49 
 
 		 392 aa  333  4e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  47.45 
 
 		 388 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  42.22 
 
 		 365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  41.16 
 
 		 362 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  40.66 
 
 		 367 aa  269  5e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  41.38 
 
 		 361 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  38.56 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  36.76 
 
 		 385 aa  209  7e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  38.72 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  36.73 
 
 		 410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  33.7 
 
 		 382 aa  169  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  27.58 
 
 		 382 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  27.58 
 
 		 382 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  26.53 
 
 		 382 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  27.91 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  26.56 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  27.76 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  27.88 
 
 		 398 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  25.59 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  25 
 
 		 368 aa  97.4  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  27.59 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  23.59 
 
 		 378 aa  95.5  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  25.2 
 
 		 377 aa  93.2  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  25 
 
 		 363 aa  92  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  28.03 
 
 		 409 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  26.54 
 
 		 411 aa  90.1  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  27.34 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  25.71 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  24.18 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  24.73 
 
 		 370 aa  86.3  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  24.63 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  25.77 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  25.24 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  24.18 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  26.33 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  24.24 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  24.49 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  24.54 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  24.17 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  26.65 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  22.9 
 
 		 367 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  22.9 
 
 		 367 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  24.46 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  26.16 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  21.52 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1049  hypothetical protein  59.65 
 
 		 84 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  26.04 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  24.59 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  24.38 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  27.13 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  29.49 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>