164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0013 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  100 
 
 		 362 aa  746    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  58.45 
 
 		 365 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  44.74 
 
 		 387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  44.74 
 
 		 387 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  43.95 
 
 		 387 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  41.09 
 
 		 410 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  40.53 
 
 		 393 aa  282  6.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  41.42 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  40.94 
 
 		 393 aa  280  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  41.6 
 
 		 386 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  42.52 
 
 		 388 aa  276  5e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  41.05 
 
 		 390 aa  275  6e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  40.36 
 
 		 395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  41.16 
 
 		 390 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  40.9 
 
 		 390 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  39.73 
 
 		 392 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  40.9 
 
 		 390 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  40.79 
 
 		 390 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  41.95 
 
 		 386 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  40.79 
 
 		 390 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  40.53 
 
 		 390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  40.37 
 
 		 388 aa  269  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  40.9 
 
 		 387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  40.58 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  38.95 
 
 		 390 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  40.8 
 
 		 392 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  40.8 
 
 		 436 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  40.8 
 
 		 392 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  40.8 
 
 		 436 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  40.8 
 
 		 436 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  40.8 
 
 		 392 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  40.8 
 
 		 436 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  41.39 
 
 		 361 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  40 
 
 		 395 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  40.53 
 
 		 386 aa  256  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  39.95 
 
 		 393 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  38.16 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  42.46 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  42.46 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  42.46 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  42.18 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  39.78 
 
 		 385 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  42.18 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  40.78 
 
 		 392 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  42.18 
 
 		 391 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  38.56 
 
 		 385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  37.43 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  39.28 
 
 		 388 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  38.35 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  38.48 
 
 		 390 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  38.48 
 
 		 390 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  38.62 
 
 		 388 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  33.06 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  38.48 
 
 		 390 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  37.83 
 
 		 392 aa  216  7e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  35.73 
 
 		 385 aa  206  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  36.12 
 
 		 410 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  36.84 
 
 		 388 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  36.52 
 
 		 385 aa  199  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  34.42 
 
 		 382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  27.06 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  25.62 
 
 		 377 aa  116  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  26.37 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  27.14 
 
 		 395 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  27.85 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  25.71 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  26.12 
 
 		 368 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  24.62 
 
 		 378 aa  106  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  27.59 
 
 		 370 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  26.93 
 
 		 411 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  24 
 
 		 382 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  24 
 
 		 382 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  25.5 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  26.46 
 
 		 398 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  26.23 
 
 		 399 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  23.48 
 
 		 370 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  26.13 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  25.47 
 
 		 399 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  26.78 
 
 		 409 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  26.4 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  23.86 
 
 		 395 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  24.86 
 
 		 416 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  23.59 
 
 		 395 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  27.57 
 
 		 424 aa  93.2  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  23.08 
 
 		 397 aa  93.2  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  25.26 
 
 		 393 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  24.93 
 
 		 394 aa  90.5  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  24.03 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  27.18 
 
 		 405 aa  87  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  25.43 
 
 		 373 aa  86.3  7e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  24.34 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  25.14 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  25.14 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  24.46 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  26.4 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  22.83 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  24.65 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  23.84 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  23.24 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  23.18 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>