233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0337 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  100 
 
 
427 aa  851    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  23.24 
 
 
399 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  19.68 
 
 
411 aa  79  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  22.02 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  21.75 
 
 
395 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  21.76 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  20.83 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  23.06 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  20.73 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  29.46 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2290  hypothetical protein  23.92 
 
 
409 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18336  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  20.05 
 
 
430 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  21.43 
 
 
398 aa  63.9  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  28.83 
 
 
382 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  21.6 
 
 
362 aa  63.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  26.8 
 
 
382 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  26.8 
 
 
382 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  21.46 
 
 
394 aa  59.7  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  25.83 
 
 
1187 aa  59.3  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  29.2 
 
 
1225 aa  56.6  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  20.25 
 
 
394 aa  56.2  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  25 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  56.52 
 
 
1181 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  25 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  21.5 
 
 
368 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  21.63 
 
 
405 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  23.62 
 
 
416 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  22 
 
 
369 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2782  hypothetical protein  29.14 
 
 
440 aa  54.3  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  27.56 
 
 
412 aa  53.5  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  23.78 
 
 
1186 aa  53.1  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  29.03 
 
 
1188 aa  53.1  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0467  SMC domain-containing protein  52.17 
 
 
1280 aa  53.1  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  26.55 
 
 
1222 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  26.55 
 
 
1195 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  32.63 
 
 
1194 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  34.21 
 
 
1141 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  45.65 
 
 
1176 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  35.53 
 
 
1205 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  36.84 
 
 
1227 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  17.99 
 
 
376 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2051  SMC domain protein  50 
 
 
1080 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.380302  normal  0.930097 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  31.58 
 
 
1199 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 
1194 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  45.65 
 
 
1176 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  28.04 
 
 
1183 aa  51.6  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  27.68 
 
 
1195 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  26.55 
 
 
1213 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  27.64 
 
 
1188 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  27.68 
 
 
1195 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  27.68 
 
 
1195 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  19.78 
 
 
530 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0822  SMC protein-like protein  39.22 
 
 
1100 aa  50.8  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.866363  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  25 
 
 
390 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  34.67 
 
 
1218 aa  50.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  36.36 
 
 
1234 aa  50.4  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  26.92 
 
 
380 aa  50.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  32.1 
 
 
1203 aa  50.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  27.4 
 
 
394 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  32.61 
 
 
385 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  28.57 
 
 
395 aa  50.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  27.34 
 
 
378 aa  50.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  30.86 
 
 
1191 aa  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  32.89 
 
 
1194 aa  50.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0318  condensin subunit Smc  50 
 
 
1307 aa  49.7  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  32.1 
 
 
1217 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  45.65 
 
 
1176 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  52.17 
 
 
1195 aa  49.7  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  32.5 
 
 
1217 aa  49.7  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  50 
 
 
1174 aa  49.7  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  32.22 
 
 
1186 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 
1172 aa  49.7  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  29.63 
 
 
1198 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  22.59 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0349  SMC protein-like  50 
 
 
1318 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  30.86 
 
 
1214 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  27.1 
 
 
1224 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  22.16 
 
 
417 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  45.65 
 
 
1139 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  32.89 
 
 
1194 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  29.63 
 
 
1198 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  28.43 
 
 
388 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1551  SMC domain-containing protein  40 
 
 
1074 aa  47.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  54.76 
 
 
1177 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  35.62 
 
 
397 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.94 
 
 
616 aa  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1095  hypothetical protein  25.24 
 
 
453 aa  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00653553  hitchhiker  0.00178411 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  49.09 
 
 
597 aa  47.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1735  chromosome segregation protein SMC  43.48 
 
 
299 aa  47.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  33.75 
 
 
1168 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  26.09 
 
 
419 aa  47.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  26.17 
 
 
1181 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  37.84 
 
 
1185 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  37.84 
 
 
1148 aa  47.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  45.65 
 
 
1172 aa  47.8  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  43.48 
 
 
1133 aa  47.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  30.86 
 
 
1191 aa  47.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  44.19 
 
 
1179 aa  47.4  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  43.48 
 
 
1147 aa  47.4  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  45.65 
 
 
993 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>