195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2178 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  100 
 
 
398 aa  822    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  78.5 
 
 
397 aa  634  1e-180  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  55.14 
 
 
386 aa  430  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  52.01 
 
 
395 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  51.36 
 
 
394 aa  326  5e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  29.17 
 
 
368 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  28.68 
 
 
377 aa  142  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  27.81 
 
 
378 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  29.97 
 
 
367 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  29.97 
 
 
367 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  28.22 
 
 
362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  28.5 
 
 
390 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  31.51 
 
 
364 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  28.72 
 
 
378 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  28.86 
 
 
370 aa  123  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  29.11 
 
 
365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  28.35 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  28.8 
 
 
382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  28.15 
 
 
390 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  27.88 
 
 
390 aa  117  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  26.46 
 
 
362 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  37.84 
 
 
365 aa  116  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  27.79 
 
 
364 aa  116  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  27.88 
 
 
390 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  37.23 
 
 
363 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  36.7 
 
 
363 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  26.92 
 
 
387 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  26.17 
 
 
369 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  29.3 
 
 
386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  27.13 
 
 
390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  27.69 
 
 
390 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  27.25 
 
 
390 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  26.99 
 
 
390 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  27.44 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  25.79 
 
 
395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  29.89 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  27.98 
 
 
410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  26.1 
 
 
382 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  26.1 
 
 
382 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  30.35 
 
 
387 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  26.41 
 
 
387 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  38.62 
 
 
378 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  28.8 
 
 
387 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  28.21 
 
 
388 aa  106  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  27.69 
 
 
376 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  26.93 
 
 
393 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  27.08 
 
 
393 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  26.34 
 
 
370 aa  104  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  26.34 
 
 
370 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  27.89 
 
 
390 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  27.89 
 
 
390 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  28.64 
 
 
416 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  27.83 
 
 
385 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  26.84 
 
 
386 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  25.66 
 
 
392 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  41.88 
 
 
226 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  27.63 
 
 
386 aa  96.7  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  26.65 
 
 
388 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  25.86 
 
 
393 aa  96.3  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  26.9 
 
 
385 aa  96.3  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  28.19 
 
 
399 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  27.14 
 
 
370 aa  94  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  26.98 
 
 
361 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  40.34 
 
 
357 aa  93.6  6e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  27.03 
 
 
388 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  26.85 
 
 
373 aa  93.2  7e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  26.98 
 
 
385 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  25.82 
 
 
367 aa  92.4  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  27.89 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  27.13 
 
 
436 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  27.13 
 
 
392 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  27.13 
 
 
436 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  27.13 
 
 
436 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  27.13 
 
 
392 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  27.13 
 
 
392 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  27.13 
 
 
436 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  28.29 
 
 
409 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  23.86 
 
 
369 aa  89.7  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  24.94 
 
 
411 aa  89.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  26.78 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  26.47 
 
 
410 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  27.25 
 
 
399 aa  87.8  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  24.94 
 
 
392 aa  87  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  26.1 
 
 
388 aa  87  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  31.88 
 
 
369 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  26.33 
 
 
397 aa  86.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  23.91 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  25.74 
 
 
430 aa  84.7  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  27.25 
 
 
398 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  26.33 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  41.05 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  25.58 
 
 
391 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  25.32 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  25.51 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  25.06 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  25.06 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  22.85 
 
 
417 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  59.42 
 
 
392 aa  78.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  36.3 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  23.33 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>