155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1858 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  766    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  766    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  99.74 
 
 
390 aa  764    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  73.08 
 
 
388 aa  548  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  71.03 
 
 
388 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  53.87 
 
 
395 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  52.01 
 
 
390 aa  378  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  50.13 
 
 
388 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  54.94 
 
 
387 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  54.8 
 
 
390 aa  363  3e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  49.87 
 
 
390 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  53.92 
 
 
387 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  49.63 
 
 
395 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  51.77 
 
 
393 aa  355  5e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  49.75 
 
 
390 aa  354  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  48.88 
 
 
410 aa  353  4e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  49.49 
 
 
390 aa  352  5e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  49.49 
 
 
390 aa  351  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  49.37 
 
 
390 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  49.12 
 
 
390 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  52.02 
 
 
385 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  49.12 
 
 
390 aa  349  4e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  47.74 
 
 
393 aa  349  6e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  50.25 
 
 
392 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  48.87 
 
 
390 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  50.13 
 
 
388 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  51.13 
 
 
393 aa  345  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  48.24 
 
 
393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  49.62 
 
 
386 aa  342  7e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  48.98 
 
 
386 aa  339  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  50 
 
 
436 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  50 
 
 
436 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  50 
 
 
436 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  50 
 
 
436 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  50 
 
 
392 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  50 
 
 
392 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  50 
 
 
392 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  52.78 
 
 
392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  51.14 
 
 
386 aa  324  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  52.24 
 
 
392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  53.28 
 
 
385 aa  320  3e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  49.23 
 
 
387 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  49.49 
 
 
387 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  48.59 
 
 
387 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  49.37 
 
 
388 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  51.13 
 
 
391 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  51.13 
 
 
391 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  50.76 
 
 
391 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  50.63 
 
 
391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  50.76 
 
 
391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  50.13 
 
 
391 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  39.69 
 
 
367 aa  241  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  37.93 
 
 
365 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  38.48 
 
 
362 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  38.66 
 
 
384 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  37.43 
 
 
385 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  40.26 
 
 
361 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  40.34 
 
 
385 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  36.02 
 
 
410 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  35.13 
 
 
382 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  28.53 
 
 
377 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  28.18 
 
 
382 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  29.01 
 
 
382 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  29.01 
 
 
382 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  27.75 
 
 
378 aa  114  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  26.39 
 
 
368 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  27.95 
 
 
369 aa  97.4  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  27.86 
 
 
370 aa  97.1  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  26.23 
 
 
397 aa  94.7  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  24.23 
 
 
367 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  24.23 
 
 
367 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  24.59 
 
 
378 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  32 
 
 
378 aa  94  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  28.01 
 
 
409 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  26.47 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  27.89 
 
 
398 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  27 
 
 
386 aa  90.5  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  27.03 
 
 
395 aa  90.1  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  25.41 
 
 
394 aa  89.7  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  26.08 
 
 
395 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  25.19 
 
 
430 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  25.52 
 
 
399 aa  87  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  25.14 
 
 
393 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  25.39 
 
 
411 aa  86.7  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  24.53 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  23.43 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  23.27 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  28.21 
 
 
376 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  23.98 
 
 
416 aa  80.9  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  25.74 
 
 
397 aa  80.1  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  22.71 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  22.64 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  23.86 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  25.71 
 
 
416 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  23.2 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  26.01 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  30.46 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1049  hypothetical protein  64.91 
 
 
84 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  32.58 
 
 
399 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  24.02 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>