170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3562 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  100 
 
 		 394 aa  798    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  26.57 
 
 		 399 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  25 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  26.25 
 
 		 409 aa  94  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  28.07 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  24.48 
 
 		 412 aa  86.3  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1514  ATPase-like protein  44.09 
 
 		 131 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  25.9 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  25.9 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1541  hypothetical protein  44 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0141757 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  25.84 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  24.57 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  21.71 
 
 		 365 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  24.51 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  25.99 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  23.38 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  23.31 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  22.92 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  26.09 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  22.31 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  22.31 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  25.26 
 
 		 364 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  24.87 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  23.88 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  23.76 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  22.88 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  22.37 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  22.66 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  23.41 
 
 		 378 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  25.07 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  23.89 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  22.31 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  21.54 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  36.21 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  22.55 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  20.75 
 
 		 416 aa  67  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  35.59 
 
 		 364 aa  67  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  25.19 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  22.69 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  35.43 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  23.14 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  40 
 
 		 642 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  36.21 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  22.25 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  20.73 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  21.02 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  22.19 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  23.06 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  22.79 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  32.7 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  23.06 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  21.58 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  22.79 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  23.14 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  21.5 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  37.04 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  21.07 
 
 		 367 aa  62  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  39.73 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  22.52 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  23.61 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  24.62 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  32.52 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  24.88 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  22.4 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  22.25 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  31.78 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  21.75 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  22.54 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  23.08 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  22.25 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  22.25 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  21.97 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  22.28 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  24.93 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  32.17 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  23.36 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  22.34 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  24.45 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  32.17 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  23.37 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5923  hypothetical protein  26.32 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  21.54 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  20.05 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  20.95 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  20.23 
 
 		 385 aa  57  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  21.18 
 
 		 390 aa  57  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  22.91 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  20.05 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  29.57 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  21.76 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  22.83 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  28.57 
 
 		 378 aa  56.2  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0344  hypothetical protein  26.01 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  22.22 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  21.56 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1106  hypothetical protein  22.99 
 
 		 372 aa  55.5  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0316487  hitchhiker  0.000249477 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  21.88 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  21.31 
 
 		 399 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  34.52 
 
 		 377 aa  53.5  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  20.11 
 
 		 416 aa  53.5  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.960092 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>